Seurat是一個老牌的單細胞分析工具了（satija的力作），我之前測試過，但是沒怎么用。

最近發現這個工具又publish在了NBT上，所以很有必要看一下這篇文章。

?

Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species

主要目的：identifying subpopulations of cells that are present across multiple data sets

主要就是為了多樣品之間的比較，甚至不同物種間的對比。

?

Overview of Seurat alignment workflow
We aimed to develop a diverse integration strategy that could compare scRNA-seq data sets across different conditions, technologies, or species.

?

Identifying shared correlation structures across data sets

Machine-learning techniques for ‘data fusion’ aim to integrate information from multiple experiments into a consistent representation.

?

待續~

轉載于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/9132338.html

總結

以上是生活随笔為你收集整理的Seurat | 单细胞分析工具的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網站內容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。