河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类
生活随笔
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河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类
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計(jì)算機(jī)高級(jí)語(yǔ)言編程實(shí)踐報(bào)告
2021年1月
基本要求:
1 學(xué)習(xí)python的Biopython包的使用(Seq,SeqRecord,SeqFeature三個(gè)class和SeqIO模塊)。編寫(xiě)代碼,完成2,3要求。
2 利用Biopython包讀取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),將其中FEATURE的類(lèi)型為CDS的序列片段及其信息截取出來(lái),包裝為SeqRecord對(duì)象,再存儲(chǔ)為fasta格式的文件:NC_045512.2_CDS.fasta。內(nèi)容格式如下所示:
>GeneID:43740578 ORF1ab cds from NC_045512.2 site:join{[265:13468](總結(jié)
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