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河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类

發(fā)布時(shí)間:2023/12/8 python 45 豆豆
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計(jì)算機(jī)高級(jí)語(yǔ)言編程實(shí)踐報(bào)告

2021年1月

基本要求:
1 學(xué)習(xí)python的Biopython包的使用(Seq,SeqRecord,SeqFeature三個(gè)class和SeqIO模塊)。編寫(xiě)代碼,完成2,3要求。

2 利用Biopython包讀取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),將其中FEATURE的類(lèi)型為CDS的序列片段及其信息截取出來(lái),包裝為SeqRecord對(duì)象,再存儲(chǔ)為fasta格式的文件:NC_045512.2_CDS.fasta。內(nèi)容格式如下所示:

>GeneID:43740578 ORF1ab cds from NC_045512.2 site:join{[265:13468](

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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