日韩性视频-久久久蜜桃-www中文字幕-在线中文字幕av-亚洲欧美一区二区三区四区-撸久久-香蕉视频一区-久久无码精品丰满人妻-国产高潮av-激情福利社-日韩av网址大全-国产精品久久999-日本五十路在线-性欧美在线-久久99精品波多结衣一区-男女午夜免费视频-黑人极品ⅴideos精品欧美棵-人人妻人人澡人人爽精品欧美一区-日韩一区在线看-欧美a级在线免费观看

歡迎訪問 生活随笔!

生活随笔

當前位置: 首頁 > 运维知识 > 数据库 >内容正文

数据库

OMIM数据库简介

發布時間:2023/12/8 数据库 60 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 OMIM数据库简介 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

歡迎關注"生信修煉手冊"!

OMIM 全稱叫做Online Mendelian Inheritance in Man, 是一個不斷更新的人類孟德爾遺傳病的數據庫。這個數據庫主要關注人類基因變異和表型性狀之間的關系。

網址如下:

https://omim.org/

數據庫中的每一條記錄,都會有一個唯一的由6位數字組成的OMIM 編號,不同數字開頭的編號含義不同,其中:

  • 數字1和2 開頭的,代表常染色體上的相關位點和表型(1995年之前創建的)

  • 數字3開頭的,代表X染色體上的相關位點和表型

  • 數字4開頭的,代表Y染色體上的相關位點和表型

  • 數字5開頭的,代表線粒體上的相關位點和表型

  • 數字6開頭的,代表常染色體上的相關位點和表型(1995 年之后創建的)

  • 對于等位基因,每一條記錄都有一個唯一的MIM 編號,由點號分隔的兩部分構成,點號之前是突變位點對應的OMIM 編號,點號之后是一個由4位數字構成的唯一ID, 用來記錄等位基因。

    以IX 基因為例,對應的等位基因有 300746.0001 和 300746.0101 兩個MIM 編號。

    這個數據庫是不斷更新的,截止到2018年5月29號,數據庫中的數據記錄如下:

    數據庫中的記錄,分成了5個類別。

    1. Gene description

    這種記錄以”*”開頭,主要記錄基因的相關信息,比如100640

    2. Gene and phenotype, combined

    這種記錄以+開頭,描述了基因和表型之間的關聯,比如100650


    在網頁上,會給出基因和表型之間的關聯

    3. Phenotype description, molecular basis known

    這種記錄以#開頭,描述了分子機制清楚的表型信息,比如100100


    在Text字段中,會給出詳細的和該表型相關的基因突變信息

    4. Phenotype description or locus, molecular basis unknown

    這種記錄以%開頭,描述了分子機制不清楚的表型信息,通常都有由多種遺傳因素控制的疾病,相關突變位點較多,比如100070

    5. Other

    其他類型的記錄,這部分記錄之前沒有任何前綴,比如10050


    目前該網站的完整數據只面向科研機構開放下載,下載頁面的鏈接如下

    https://omim.org/downloads/

    其中的mim2gene.txt是大家都可以下載的,里面有數據庫所有記錄的編號。

    第一列的ID就是omim編號,知道編號之后,可以快速得到對應的頁面,鏈接格式如下

    https://omim.org/entry/100640

    雖然不能下載到完整的數據庫,但是只需要根據編號,也可以快速得到想要的信息。如果你編程能力夠強,也可以抓取所有的網頁,構建一個本地版的數據庫。

    掃描關注微信號,更多精彩內容等著你!

    總結

    以上是生活随笔為你收集整理的OMIM数据库简介的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

    如果覺得生活随笔網站內容還不錯,歡迎將生活随笔推薦給好友。