單分子DNA技術就是指第三代測序技術或者從頭測序技術。它實現了DNA聚合酶內在自身的反應速度，據說一秒可以測10 個堿基，測序速度是化學法測序的2萬倍。而且實現了DNA聚合酶內在自身的延續性，一個反應就可以測非常長的序列。二代測序現在可以測到上百個堿基，但是三代測序現在就可以測幾千個堿基。它的精度非常高，可以達到99.9999%。

單分子測序是新一代測序發展出來的新方法，根據測序原理的不同也有好幾種，這里說下其中一種，全稱為單分子實時DNA測序技術（SMRT），采用這種技術，可以使得測序讀長超過5000個堿基，這種測序方法可以幫助研究人員獲得高分辨率的基因組圖譜，對于結構變異的研究十分有幫助。曾有人用這種方法研究葡萄胎基因組，共識別鑒定出與人類參考基因組不同的26079個變異片段，其中約有兩萬多個變異在此前從未被發現過。

哈佛醫學院的George M. Church領導的團隊開發了一種單分子互作測序（SMI-seq）技術，這種方法能夠精確定量多種蛋白，理論上這個陣列的密度可以達到每平方毫米一百萬polonies。 該技術能夠實現單分子水平上的并行分析，獲得大量蛋白質的互作圖譜，研究人員利用PRMC復合體（蛋白質-核糖體-mRNA-互補DNA），通過體外的核糖體展示（ribosome display）技術，將DNA條碼連到蛋白質上，這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析，并在一個聚丙烯酰胺薄膜中被固定，接下來，條碼RNA被放大，并通過DNA測序被分析，該方法可以實現精確的蛋白量化以及對分子結合親和力和特異性的同時測定。

總結

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