BGISEQ-1000基因測序儀基于CG平臺，配套的試劑盒為胎兒染色體非整倍體（T21、T18、T13）檢測試劑盒（聯合探針錨定連接測序法）。CG平臺的特點是通量高，但周期較長，因此BGISEQ-1000應該主要會應用于全國范圍內的樣品，集中測序分析；BGISEQ-100基因測序儀基于Ion Torrent平臺，配套的試劑盒為胎兒染色體非整倍體（T21、T18、T13）檢測試劑盒（半導體測序法）。Ion Torrent平臺的特點是測序周期短，可靈活部署，BGISEQ-100有很大可能會被部署到有一定業務量的大中型醫院，就地采樣、測序、分析并出具報告.

BGISEQ-1000是基于華大基因在2013年收購美國測序儀生產商CG（Complete Genomics）的原有測序儀；BGISEQ-100則是基于Life Technologies公司的Ion Proton測序平臺。據了解，華大基因BGISEQ-1000對實驗室環境要求苛刻，而且難以小型化。且早前的定位是人全基因組測序，并不適用于無創產前檢測。華大基因將CG收購之后曾委托一家日本公司進行改造，被業內認為難以產品化并部署到醫院。

總結

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