相比于第一代测序技术,二代测序技术有何优点?
生活随笔
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相比于第一代测序技术,二代测序技术有何优点?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
第一代測(cè)序技術(shù)的主要特點(diǎn)是測(cè)序讀長(zhǎng)可達(dá)1000bp,準(zhǔn)確性高達(dá)99.999%,但其測(cè)序成本高,通量低等方面的缺點(diǎn),嚴(yán)重影響了其真正大規(guī)模的應(yīng)用。而第二代測(cè)序技術(shù)大大降低了測(cè)序成本的同時(shí),還大幅提高了測(cè)序速度,并且保持了高準(zhǔn)確性。有助于人們以更低廉的價(jià)格,更全面、更深入地分析基因組、轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)之間交互作用組的各項(xiàng)數(shù)據(jù)。以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則僅僅需要1周,但在序列讀長(zhǎng)方面比起第一代測(cè)序技術(shù)則要短很多。
樓上說(shuō)得很對(duì),一方面是測(cè)序通量更大,另一方面是測(cè)序成本更低。第二代測(cè)序技術(shù)最顯著的特征是高通量, 一次能對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA 分子進(jìn)行序列測(cè)序, 使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序或基因組深度測(cè)序變得方便易行。新一代測(cè)序技術(shù)將片段化的基因組DNA 兩側(cè)連上接頭, 隨后用不同的方法產(chǎn)生幾百萬(wàn)個(gè)空間固定的PCR 克隆陣列。每個(gè)克隆由單個(gè)文庫(kù)片段的多個(gè)拷貝組成。然后進(jìn)行引物雜交和酶延伸反應(yīng)。由于所有的克隆都在同一平面上, 這些反應(yīng)就能夠大規(guī)模平行進(jìn)行, 每個(gè)延伸反應(yīng)所摻入的熒光標(biāo)記的成像檢測(cè)也能同時(shí)進(jìn)行, 從而獲得測(cè)序數(shù)據(jù)。 DNA 序列延伸和成像檢測(cè)不斷重復(fù), 最后經(jīng)過(guò)計(jì)算機(jī)分析就可以獲得完整的DNA序列信息。
樓上說(shuō)得很對(duì),一方面是測(cè)序通量更大,另一方面是測(cè)序成本更低。第二代測(cè)序技術(shù)最顯著的特征是高通量, 一次能對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA 分子進(jìn)行序列測(cè)序, 使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序或基因組深度測(cè)序變得方便易行。新一代測(cè)序技術(shù)將片段化的基因組DNA 兩側(cè)連上接頭, 隨后用不同的方法產(chǎn)生幾百萬(wàn)個(gè)空間固定的PCR 克隆陣列。每個(gè)克隆由單個(gè)文庫(kù)片段的多個(gè)拷貝組成。然后進(jìn)行引物雜交和酶延伸反應(yīng)。由于所有的克隆都在同一平面上, 這些反應(yīng)就能夠大規(guī)模平行進(jìn)行, 每個(gè)延伸反應(yīng)所摻入的熒光標(biāo)記的成像檢測(cè)也能同時(shí)進(jìn)行, 從而獲得測(cè)序數(shù)據(jù)。 DNA 序列延伸和成像檢測(cè)不斷重復(fù), 最后經(jīng)過(guò)計(jì)算機(jī)分析就可以獲得完整的DNA序列信息。
總結(jié)
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