人重测序的SNP和SV变异位点对药物靶点发现有何作用?
生活随笔
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人重测序的SNP和SV变异位点对药物靶点发现有何作用?
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重測序能夠檢測全基因組的罕見變異,可以獲得大量的單核苷酸多態性(SNP)信息、序列的插入缺失位點信息,還可以檢測到多種結構變異(SV)和拷貝數變化(CNV)。利用測序結果,未來我們著重于根據個體SNP差異進行個性化醫療,即根據每個人不同的遺傳背景選擇最適合個人的用藥及治療方案。同時,測序結果在疾病風險預測(第三方醫療檢測),腫瘤治療(早診,生物標志物發現),新藥研發(藥廠用于發現新的藥物靶標)中有廣泛的應用。
樓上說得不錯,做點補充:在全基因組一致性序列的基礎上,從中提取全基因組中所有的潛在多態性位點,再根據質量值、深度、重復性等因素做進一步的過濾篩選,最終得到高可信度的SNP數據集。根據已有的基因集對檢測到得變異進行注釋。利用測序個體序列與參考基因組序列進行比對,檢測全基因組水平的結構變異(SV),目前能夠檢測到得結構變異類型主要有缺失、插入、復制、倒位、易位等,并根據已有的基因集對檢測到得變異進行注釋。
樓上說得不錯,做點補充:在全基因組一致性序列的基礎上,從中提取全基因組中所有的潛在多態性位點,再根據質量值、深度、重復性等因素做進一步的過濾篩選,最終得到高可信度的SNP數據集。根據已有的基因集對檢測到得變異進行注釋。利用測序個體序列與參考基因組序列進行比對,檢測全基因組水平的結構變異(SV),目前能夠檢測到得結構變異類型主要有缺失、插入、復制、倒位、易位等,并根據已有的基因集對檢測到得變異進行注釋。
總結
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