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NGS会取代基因芯片吗?

發(fā)布時間:2023/11/24 万象百科 44 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 NGS会取代基因芯片吗? 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
芯片是采用數(shù)據(jù)庫或已報道文獻(xiàn)設(shè)計基因特異性的探針檢測樣本中差異基因的表達(dá),研究內(nèi)容有mRNA,miRNA,lncRNA等,芯片平臺是一個封閉的,檢測的都是已知的基因;NGS是高通量測序即二代測序,克服了芯片物種限制,可以對任意物種進(jìn)行測序,發(fā)現(xiàn)新的基因,是一個開放平臺,目前兩者不能互相取代。或許當(dāng)?shù)谌鷾y序技術(shù)成熟后可能代替芯片。

至少目前還不會吧?;蛐酒谏蟼€世紀(jì)九十年代,被廣泛看好,其高通量優(yōu)勢被認(rèn)為是最好的診斷技術(shù)。但是基因芯片有個特點就是不能對未知的基因片段進(jìn)行檢測,導(dǎo)致現(xiàn)在二代測序不斷擠兌基因芯片。但還不能完全取代,因為目前,基因芯片還有它獨特的優(yōu)勢,比如說基因組拷貝數(shù)異常檢測。按道理說,加大基因芯片拷貝數(shù)片段密度進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)處理的話,基因芯片也是可以做NIPT的。從成熟度、成本、法規(guī)管理、效率上講,基因芯片和NGS還是會并存一段時間。中國FDA對基因芯片歸為二類醫(yī)療器械進(jìn)行管理,而將NGS列為三類。

NGS是高通量、快速、經(jīng)濟的基因組測序技術(shù)。而芯片是利用的SNP、CNV相當(dāng)于作為已知的特異性探針來和未知的基因序列進(jìn)行雜交,通過計算、生物信息學(xué)手段來判斷基因序列是否存在突變、重復(fù)、確實等異常。目前兩者不能互相取代?;蛟S當(dāng)?shù)谌鷾y序技術(shù)成熟后可能代替芯片。

總結(jié)

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