最近看到的發(fā)表在Science公布油菜基因組測序結(jié)果，說明DNA測序技術(shù)在植物鑒別方面的應(yīng)用較快，油菜作為一種主要的經(jīng)濟(jì)作物，對其的開發(fā)和利用具有重要的意義。來自法國農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發(fā)表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”的文章，公布了油菜（Brassica> napus）的基因組序列，這將有助于了解此類植物（包含來自多物種的染色體）的進(jìn)化歷史，以及其在進(jìn)化過程中的地位。 這一研究成果公布在8月22日Science雜志上。

高通量測序技術(shù)應(yīng)用于動植物基因組學(xué)和功能基因組學(xué)研究，包括全基因組de novo測序、全基因組重測序、簡化基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、數(shù)字基因表達(dá)譜技術(shù)、小RNAs 測序、降解組測序和基于測序的表觀基因組學(xué)技術(shù)。關(guān)于全基因組重測序：核心種質(zhì)資源品系基因組重測序，群體基因組重測序，重測序構(gòu)建遺傳圖譜，重測序發(fā)現(xiàn)突變位點(diǎn)，基因組重測序用于 GWAS研究和外顯子組和目標(biāo)區(qū)域測序。相比于全基因組重測序, 外顯子組和目標(biāo)區(qū)域測序更加經(jīng)濟(jì)、 高效。目前, 在醫(yī)學(xué)基因組學(xué)研究領(lǐng)域，外顯子組和目標(biāo)區(qū)域測序技術(shù)已經(jīng)應(yīng)用到尋找人類各種疾病相關(guān)的致病基因和易感基因的研究中, 而在動植物研究中已有報(bào)道主要集中在小鼠中, 在大豆、牛(Bos taurus)、果蠅(Drosophila melanogaster)等物種中也有部分報(bào)道。現(xiàn)在高通量測序已被廣泛應(yīng)用于以轉(zhuǎn)錄組測序等為代表的功能基因組學(xué)研究中。對有參考基因組序列的物種, 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)可以大大豐富和驗(yàn)證對基因組數(shù)據(jù)的注釋, 而該技術(shù)本身可用于不同樣本間基因表達(dá)差異、可變剪接等的比較。在無參考基因組序列的物種中, 轉(zhuǎn)錄組測序可以大量且快速地充實(shí)該物種的遺傳數(shù)據(jù)庫, 這些數(shù)據(jù)資源可有助于在該物種中進(jìn)一步開展分子生物學(xué)研究。隨高通量測序技術(shù)而出現(xiàn)的數(shù)字基因表達(dá)譜DGE)測序、小 RNAs 測序、降解組測序、DNA 甲基化測序、染色質(zhì)免疫共沉淀 DNA 測序等新方法為科學(xué)家們進(jìn)行分子生物學(xué)相關(guān)研究提供了更多的選擇。

DNA測序在植物鑒別方面最近有一項(xiàng)關(guān)于利用該技術(shù)鑒別引起AIDS病人真菌感染的來源樹木的研究報(bào)道：研究人員已準(zhǔn)確找到一種隱球菌屬（Cryptococcus）真菌的環(huán)境來源。該真菌簡直是生長在樹上的。該真菌屬，由包括Cryptococcus gattii（C. gattii）在內(nèi)的許多種真菌組成，可引起威脅生命的肺部和腦部感染，并導(dǎo)致1/3的HIV/AIDS病人死亡。它已影響加利福尼亞州南部數(shù)十年。該發(fā)現(xiàn)是基于一名13歲女孩的科學(xué)項(xiàng)目，她花費(fèi)整個夏天從受C. gattii影響最嚴(yán)重的洛杉磯附近區(qū)域收集土壤和樹木樣本。研究人員對這些樣本進(jìn)行DNA測序，并與從受C. gattii感染的AIDS病人身上獲得的DNA序列進(jìn)行比較。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，三個樹種的樣本在遺傳學(xué)上與病人樣本幾乎不可區(qū)分。這三個樹種是，卡內(nèi)里松（Canary Island pine）、桃金娘科常綠樹（Pohutukawa）和美國楓香樹（American sweetgum）。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的DNA测序在动植物鉴别方面应用如何？有什么最新进展？的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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