目前有哪些主要的商业DNA数据存储平台?
生活随笔
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目前有哪些主要的商业DNA数据存储平台?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)概念股一覽 達(dá)安基因(002030)公司在基因診斷技術(shù)及其試劑產(chǎn)品的研制、開(kāi)發(fā)和應(yīng)用上始終處于領(lǐng)先地位。 中新藥業(yè)(600329)參股25%天津生物芯片技術(shù)有限責(zé)任公司。該公司是我國(guó)五大生物芯片研發(fā)基地之一,具有世界先進(jìn)水平。 星湖科技(600866)控股上海博星基因芯片有限責(zé)任公司是中國(guó)最大規(guī)模的基因芯片研發(fā)、生產(chǎn)和經(jīng)營(yíng)企業(yè)之一,是一家集高新科技與優(yōu)質(zhì)服務(wù)于一體的生物芯片公司,博星公司能提供各類生物芯片產(chǎn)品、相關(guān)技術(shù)服務(wù)在內(nèi)的全套解決方案,產(chǎn)品有各類表達(dá)譜芯片,疾病檢測(cè)芯片,商檢芯片等三十幾個(gè)品種。
@十四先生 抄新聞沒(méi)啥意思華大的EasyGenomics基本上沒(méi)有運(yùn)營(yíng)了吧;BaseSpace做得很爛,國(guó)內(nèi)幾乎沒(méi)法用;DNANexus拿完C輪之后就換了CEO,把founder給廢了,日子顯然過(guò)得不怎么樣;另外一家不熟悉。另外,什么叫做商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)?光是存DNA數(shù)據(jù)?沒(méi)搞懂。光說(shuō)說(shuō)生物信息公司吧。除了這四家,SevenBridges Genomics的日子比DNANexus悠閑多了;還有Church的生物信息團(tuán)隊(duì)發(fā)展起來(lái)的生物信息公司也拿到了種子基金;Tute Genomics和Bina也都不錯(cuò);華大基因可能還會(huì)放出其他大招~~
1.數(shù)據(jù)處理平臺(tái):平臺(tái)能否可靠依靠于數(shù)據(jù)是否適合這個(gè)平臺(tái),測(cè)序數(shù)據(jù)目前有各種問(wèn)題,機(jī)械的平臺(tái)就難以承擔(dān)這個(gè)任務(wù),不過(guò)我相信會(huì)越來(lái)越好。2.數(shù)據(jù)儲(chǔ)存平臺(tái):脫離樣本可追溯、樣本注釋的DNA測(cè)序數(shù)據(jù)實(shí)際上沒(méi)有任何價(jià)值,就這個(gè)標(biāo)準(zhǔn)來(lái)看目前各家公司的數(shù)據(jù)都不靠譜,沒(méi)有必要存儲(chǔ)。
目前主要的商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái):DNAnexus這是一家備受Google看好的DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)公司。DNAnexus讓用戶把測(cè)序數(shù)據(jù)存到其服務(wù)器上,再以極低的價(jià)格提供標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。Flatiron Health這是一家大數(shù)據(jù)腫瘤醫(yī)療行業(yè)的初創(chuàng)公司,目前已完成了1.3億美元B輪融資,由谷歌旗下風(fēng)投機(jī)構(gòu)谷歌風(fēng)投(Google Ventures)領(lǐng)投,成立于 2012 年。它瞄準(zhǔn)的是一個(gè)少人踏足的數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域——癌癥患者的腫瘤數(shù)據(jù)。BaseSpaceBaseSpace是Illumina創(chuàng)新的云計(jì)算平臺(tái),Basespace擁有6個(gè)獨(dú)立的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用程序:重測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、16S宏基因組、de novo裝配(由Velvet支持)、小分子RNA和文庫(kù)QC。目前利用Illumina Experiment Manager(Illumina實(shí)驗(yàn)管理器),在樣品表設(shè)置時(shí)選擇好所需的分析,運(yùn)行開(kāi)始后數(shù)據(jù)就直接傳輸?shù)紹aseSpace。EasyGenomicsEasyGenomics是華大基因2012年第一個(gè)自主開(kāi)發(fā)的云服務(wù)產(chǎn)品,該平臺(tái)集基因組學(xué)領(lǐng)域內(nèi)常用的和華大基因特有的數(shù)據(jù)及參數(shù)為一體,結(jié)合云存儲(chǔ)和高性能計(jì)算技術(shù),能夠以更低的成本、更高的效率完成大量的基因數(shù)據(jù)處理及分析。目前,華大基因已經(jīng)擁有212TFlops的峰值計(jì)算能力,總內(nèi)存容量已達(dá)到37.2TB,總存儲(chǔ)能力已達(dá)到17PB。
基因測(cè)序目前正在全球蓬勃發(fā)展,隨著測(cè)序行業(yè)進(jìn)入高通量測(cè)序階段,全球每天都會(huì)產(chǎn)生巨量的數(shù)據(jù),而illumina在2014年年初發(fā)布的高通量測(cè)序儀Hiseq X Ten的單臺(tái)儀器每次運(yùn)行可產(chǎn)出高達(dá)1.8Tb的數(shù)據(jù),每臺(tái)儀器每天產(chǎn)出約600Gb的數(shù)據(jù)。龐大的數(shù)據(jù)存儲(chǔ),需要DNA數(shù)據(jù)平臺(tái)來(lái)存儲(chǔ)這些數(shù)據(jù)。由于DNA數(shù)據(jù)中潛藏著個(gè)人遺傳信息,未來(lái)它潛藏著巨大的價(jià)值。打造DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái),也是目前很多測(cè)序公司積極準(zhǔn)備的一項(xiàng)工作,目前主要的商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)有:DNAnexus,F(xiàn)latiron Health,BaseSpace,EasyGenomics。
@十四先生 抄新聞沒(méi)啥意思華大的EasyGenomics基本上沒(méi)有運(yùn)營(yíng)了吧;BaseSpace做得很爛,國(guó)內(nèi)幾乎沒(méi)法用;DNANexus拿完C輪之后就換了CEO,把founder給廢了,日子顯然過(guò)得不怎么樣;另外一家不熟悉。另外,什么叫做商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)?光是存DNA數(shù)據(jù)?沒(méi)搞懂。光說(shuō)說(shuō)生物信息公司吧。除了這四家,SevenBridges Genomics的日子比DNANexus悠閑多了;還有Church的生物信息團(tuán)隊(duì)發(fā)展起來(lái)的生物信息公司也拿到了種子基金;Tute Genomics和Bina也都不錯(cuò);華大基因可能還會(huì)放出其他大招~~
1.數(shù)據(jù)處理平臺(tái):平臺(tái)能否可靠依靠于數(shù)據(jù)是否適合這個(gè)平臺(tái),測(cè)序數(shù)據(jù)目前有各種問(wèn)題,機(jī)械的平臺(tái)就難以承擔(dān)這個(gè)任務(wù),不過(guò)我相信會(huì)越來(lái)越好。2.數(shù)據(jù)儲(chǔ)存平臺(tái):脫離樣本可追溯、樣本注釋的DNA測(cè)序數(shù)據(jù)實(shí)際上沒(méi)有任何價(jià)值,就這個(gè)標(biāo)準(zhǔn)來(lái)看目前各家公司的數(shù)據(jù)都不靠譜,沒(méi)有必要存儲(chǔ)。
目前主要的商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái):DNAnexus這是一家備受Google看好的DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)公司。DNAnexus讓用戶把測(cè)序數(shù)據(jù)存到其服務(wù)器上,再以極低的價(jià)格提供標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。Flatiron Health這是一家大數(shù)據(jù)腫瘤醫(yī)療行業(yè)的初創(chuàng)公司,目前已完成了1.3億美元B輪融資,由谷歌旗下風(fēng)投機(jī)構(gòu)谷歌風(fēng)投(Google Ventures)領(lǐng)投,成立于 2012 年。它瞄準(zhǔn)的是一個(gè)少人踏足的數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域——癌癥患者的腫瘤數(shù)據(jù)。BaseSpaceBaseSpace是Illumina創(chuàng)新的云計(jì)算平臺(tái),Basespace擁有6個(gè)獨(dú)立的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用程序:重測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、16S宏基因組、de novo裝配(由Velvet支持)、小分子RNA和文庫(kù)QC。目前利用Illumina Experiment Manager(Illumina實(shí)驗(yàn)管理器),在樣品表設(shè)置時(shí)選擇好所需的分析,運(yùn)行開(kāi)始后數(shù)據(jù)就直接傳輸?shù)紹aseSpace。EasyGenomicsEasyGenomics是華大基因2012年第一個(gè)自主開(kāi)發(fā)的云服務(wù)產(chǎn)品,該平臺(tái)集基因組學(xué)領(lǐng)域內(nèi)常用的和華大基因特有的數(shù)據(jù)及參數(shù)為一體,結(jié)合云存儲(chǔ)和高性能計(jì)算技術(shù),能夠以更低的成本、更高的效率完成大量的基因數(shù)據(jù)處理及分析。目前,華大基因已經(jīng)擁有212TFlops的峰值計(jì)算能力,總內(nèi)存容量已達(dá)到37.2TB,總存儲(chǔ)能力已達(dá)到17PB。
基因測(cè)序目前正在全球蓬勃發(fā)展,隨著測(cè)序行業(yè)進(jìn)入高通量測(cè)序階段,全球每天都會(huì)產(chǎn)生巨量的數(shù)據(jù),而illumina在2014年年初發(fā)布的高通量測(cè)序儀Hiseq X Ten的單臺(tái)儀器每次運(yùn)行可產(chǎn)出高達(dá)1.8Tb的數(shù)據(jù),每臺(tái)儀器每天產(chǎn)出約600Gb的數(shù)據(jù)。龐大的數(shù)據(jù)存儲(chǔ),需要DNA數(shù)據(jù)平臺(tái)來(lái)存儲(chǔ)這些數(shù)據(jù)。由于DNA數(shù)據(jù)中潛藏著個(gè)人遺傳信息,未來(lái)它潛藏著巨大的價(jià)值。打造DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái),也是目前很多測(cè)序公司積極準(zhǔn)備的一項(xiàng)工作,目前主要的商業(yè)DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)有:DNAnexus,F(xiàn)latiron Health,BaseSpace,EasyGenomics。
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的目前有哪些主要的商业DNA数据存储平台?的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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