微生物基因簇指的是什么?一般可产生哪些物质?是否可用于药物开发?
生活随笔
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微生物基因簇指的是什么?一般可产生哪些物质?是否可用于药物开发?
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微生物基因簇指微生物基因家族中的各成員緊密成簇排列成大串的重復單位,位于染色體的特殊區域。這些基因各自編碼的酶常能組成多酶復合物,能催化代謝中的特定反應。從其功能來看,我們是可以利用基因簇來進行藥物開發的。
微生物基因簇可用于藥物開發:根據加州大學舊金山分校(UCSF)日前發表于《Cell》上的新發現,正常生活于我們體內和體表的細菌具有制造數以千計類藥物(drug-like)分子的基因藍圖,這些分子中的一些或可作為新人類藥物療法的基礎。他們開發出一種稱為“ClusterFinder”的數學算法,使用該算法首次系統性地分析了來自我們的微生物組的基因組及來自人體樣本的基因活性數據,鑒別得到存在于不同機體部位的3118種獨特細菌基因簇。這些基因簇編碼一些酶類,這些酶類生產特異性的類藥物分子。他們對所鑒別出的這些分子中的一個進行精制并闡明了其結構,從而得到一種稱為“lactocillin”的抗生素。該抗生素由發現于陰道微生物群落中的常見菌種加氏乳桿菌(Lactobacillus gasseri)制造。該抗生素可殺死幾種陰道細菌病原體,但并不會殺死無害陰道菌種。該抗生素與由藥企開發的經臨床測試的一些抗生素緊密相關。
微生物基因簇是一組緊密連鎖的且功能上密切相關的結構基因,多見于脈孢菌(Neurospora)等真菌中。微生物的基因組能夠合成大量的特殊化合物,但人們目前還缺乏將基因與特殊分子關聯起來的有效方法。為此,加州大學的研究人員在TAR(transformation-associated recombination)克隆的基礎上開發了一個基因操作平臺,TAR克隆能夠通過同源重組直接捕獲基因組中的大基因座。研究指出,這一技術可以根據未知基因簇有效生產天然分子。一種海洋微生物的taromycin基因簇,與達托霉素(daptomycin)的生物合成通路非常相似。達托霉素是一種被批準用于臨床的抗生素,可以治療多重耐藥菌造成的感染。這一技術能夠幫助人們挖掘無數神秘微生物的藥物研發潛力。
微生物基因簇可用于藥物開發:根據加州大學舊金山分校(UCSF)日前發表于《Cell》上的新發現,正常生活于我們體內和體表的細菌具有制造數以千計類藥物(drug-like)分子的基因藍圖,這些分子中的一些或可作為新人類藥物療法的基礎。他們開發出一種稱為“ClusterFinder”的數學算法,使用該算法首次系統性地分析了來自我們的微生物組的基因組及來自人體樣本的基因活性數據,鑒別得到存在于不同機體部位的3118種獨特細菌基因簇。這些基因簇編碼一些酶類,這些酶類生產特異性的類藥物分子。他們對所鑒別出的這些分子中的一個進行精制并闡明了其結構,從而得到一種稱為“lactocillin”的抗生素。該抗生素由發現于陰道微生物群落中的常見菌種加氏乳桿菌(Lactobacillus gasseri)制造。該抗生素可殺死幾種陰道細菌病原體,但并不會殺死無害陰道菌種。該抗生素與由藥企開發的經臨床測試的一些抗生素緊密相關。
微生物基因簇是一組緊密連鎖的且功能上密切相關的結構基因,多見于脈孢菌(Neurospora)等真菌中。微生物的基因組能夠合成大量的特殊化合物,但人們目前還缺乏將基因與特殊分子關聯起來的有效方法。為此,加州大學的研究人員在TAR(transformation-associated recombination)克隆的基礎上開發了一個基因操作平臺,TAR克隆能夠通過同源重組直接捕獲基因組中的大基因座。研究指出,這一技術可以根據未知基因簇有效生產天然分子。一種海洋微生物的taromycin基因簇,與達托霉素(daptomycin)的生物合成通路非常相似。達托霉素是一種被批準用于臨床的抗生素,可以治療多重耐藥菌造成的感染。這一技術能夠幫助人們挖掘無數神秘微生物的藥物研發潛力。
總結
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