如何检测引物的纯度?
生活随笔
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如何检测引物的纯度?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
實(shí)驗(yàn)室方便的做法是用PAGE方法。使用加有7M尿素的16%的聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳。取0.2-0.5OD的引物,用尿素飽和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到飽和,上樣前加熱變性(95℃,2mins)。加入尿素的目的一是變性,二是增加樣品比重,容易加樣。600V電壓進(jìn)行電泳,一定時間后(約2-3小時),剝膠,用熒光TLC板在紫外燈下檢測帶型,在主帶之下沒有雜帶,說明純度是好的。如果條件許可,也可以用銀染方式染色。
這個可以直接觀察核酸的整條曲線,那比光靠260,280兩個吸收值,肯定要準(zhǔn)確很多。可以跑一下瓊脂糖凝膠電泳,如果上下游引物亮度差很多,則可能是引物有問題。
除了常見的PAGE還有以下方法:高效液相色譜 (HPLC)以離子交換樹脂為填充料,可以非常有效的檢測出N-1或N-2短片段。毛細(xì)管凝膠電泳(CGE)基于尺寸排阻機(jī)理,可實(shí)現(xiàn)單核苷酸分離,可用于測定寡核苷酸純度,分辨率高,定量準(zhǔn)確。質(zhì)譜分析 (MS)MS是用電場和磁場將運(yùn)動的離子按它們的質(zhì)荷比分離后進(jìn)行檢測的方法。
這個可以直接觀察核酸的整條曲線,那比光靠260,280兩個吸收值,肯定要準(zhǔn)確很多。可以跑一下瓊脂糖凝膠電泳,如果上下游引物亮度差很多,則可能是引物有問題。
除了常見的PAGE還有以下方法:高效液相色譜 (HPLC)以離子交換樹脂為填充料,可以非常有效的檢測出N-1或N-2短片段。毛細(xì)管凝膠電泳(CGE)基于尺寸排阻機(jī)理,可實(shí)現(xiàn)單核苷酸分離,可用于測定寡核苷酸純度,分辨率高,定量準(zhǔn)確。質(zhì)譜分析 (MS)MS是用電場和磁場將運(yùn)動的離子按它們的質(zhì)荷比分離后進(jìn)行檢測的方法。
總結(jié)
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