ChIP技術最大的優點是該技術是一種體內技術,繪制的轉錄因子DNA結合譜是一類體內DNA結合譜。原理上ChIP技術所捕獲的DNA是細胞內與轉錄因子發生結合的DNA,這些DNA應是具有調控功能的DNA,但實際情況卻并非這樣理想。首先,ChIP實驗對抗體的品質要求高,品質較差的抗體以及免疫沉淀環節的低嚴緊性洗滌往往造成非特異性DNA的沉淀,產生高背景和假陽性。另外,ChIP技術由于受實驗原理的限制,只能鑒定出某種轉錄因子在一種細胞中一個很短時間(甲醛交聯點)內處于結合態的DNA,很難反映出一種轉錄因子在不同組織細胞、不同發育階段、不同刺激狀態下所作用的全部DNA靶點。除此之外,抗體和轉錄因子蛋白的結合也受眾多因素的干擾,使得部分蛋白質結合的DNA也難以被ChIP捕獲。例如,增強體中的其他蛋白質可能屏蔽轉錄因子與抗體的結合,導致部分DNA信息流失。另外,從ChIP獲得的DNA長片段(一般200~500bp)中確定轉錄因子的精確DNA結合靶點(一般6~10bp)也比較困難。近年來的研究還表明,有些轉錄因子常常表現出能夠結合非經典的DNA序列,要從ChIP片段中確定這類DNA靶點,難度更大。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的ChIP技术的优势劣势是什么？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網站內容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。