有谁能说明下什么是Bind-n-Seq技术么?
生活随笔
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有谁能说明下什么是Bind-n-Seq技术么?
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2009年,美國加州大學基因組中心的Zykovich等首次使用SELEX技術聯合下游多重平行測序技術實現了對DNA結合蛋白Zif268和Aart結合位點的同時鑒定,此技術被稱之為Bind-n-Seq。該研究首次表明將經典的SELEX技術與高通量DNA測序技術相結合,可用于研究轉錄因子高分辨率精細DNA結合模體。為了充分利用高通量DNA測序技術巨大的測序通量,該技術對不同轉錄因子蛋白篩選的DNA樣品使用了堿基條形碼技術。在測序之前將這些樣品混合,作為一個測序樣品進行測序,這樣可極大地降低實驗成本。傳統SELEX-克隆測序實驗僅能獲得幾十條到數百條DNA序列信息,SELEX-SGAE技術可獲得數千條DNA序列信息,而Bind-n-Seq技術首次將SELEX篩選DNA的序列解碼能力提高到數百萬條,在轉錄因子體外結合研究中真正實現了結合譜的繪制。
總結
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