目前主要的DNA数据库有哪些?
生活随笔
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目前主要的DNA数据库有哪些?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
國際上比較重要的核酸(含蛋白質)一級數據庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個數據庫信息共享,每日交換,故資料是一樣的,唯格式有所不同。中國的DNA系統是最近10年間才發展起來的,DNA數據庫系統,有數據量大,增長量快,比對復雜等特點。GenBank是美國國家生物技術信息中心建立的DNA序列數據庫,從公共資源中獲取序列數據,主要是科研人員直接提供或來源于大規模基因組測序計劃。為保證數據盡可能的完全,GenBank與EMBL、DDBJ建立了相互交換數據的合作關系。EMBL是歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創建的一個核酸序列數據庫。EMBL的數據來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網絡直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利。DDBJ是DNA Data Bank of Japan的簡稱,始建于1986年,由日本國立遺傳學研究院負責數據庫的建設,維護及數據的傳播,并與EMBL和GenBank合作;可以從世界各地通過網絡把序列直接提交該數據庫。DDBJ網頁上也提供了包括FastA和BLAST在內的數據庫查詢工具。此外,較大型的數據庫還有日本的dbEST以及美國的GSDB,dbEST有自己的格式和識別代碼系統,序列信息以及dbEST的注釋摘要,也按DNA的分類分成了若干子數據庫。GSDB由位于新墨西哥州Santa Fe的國家基因組資源中心創建。GSDB收集、管理并且發送完整的DNA序列及其相關信息,以滿足主要基因組測序機構的需要。除了涵蓋從完整基因組到單個基因各個方面的綜合DNA序列數據庫,還有些更有針對性的基因組資源,或稱專用數據庫。它們主要的目的是為某一特定的物種提供一個更為完整的數據庫資源,如模式生酵母、 線蟲、果蠅、擬南芥、幽門螺桿菌等。
補充樓上,歐洲的EMBL 數據庫,是歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創建的一個核酸序列數據庫。來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網絡直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利(Stoesser等, 1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關系,他們分別在全世界范圍內收集核酸序列信息,每天都將新發現或更新過的數據相互交換。
你好,目前,主要的DNA數據庫有3個。它們分別是美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個數據庫信息共享,每日交換。
補充樓上,歐洲的EMBL 數據庫,是歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創建的一個核酸序列數據庫。來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網絡直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利(Stoesser等, 1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關系,他們分別在全世界范圍內收集核酸序列信息,每天都將新發現或更新過的數據相互交換。
你好,目前,主要的DNA數據庫有3個。它們分別是美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個數據庫信息共享,每日交換。
總結
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