工廠中用于生產生物藥物的細胞系主要是原核細胞和真核細胞，使用的生物反應器包括攪拌式生物反應器，中空纖維式反應器，微載體攪拌式反應器，流化床式反應器，固定床式反應器。其中，FDA批準的主流生物反應器是攪拌式生物反應器，也是現在世界上生產體積最大的反應器，被工廠廣泛采用。

生產藥物的生物反應器主要有3種類型,即植物反應器、動物反應器和微生物反應器。不同生物反應器依所使用的不同生物體而定義的。目前以微生物反應器最多,但是植物與動物反應器已成為研究的主題,因為它們有著原核生物不可替代的優點。與微生物和動物反應器相比較,植物反應器的優點在于它的經濟性,這對于人口達13億的我國來說,是一個非常令人振奮的喜訊,由此我國政府和有關部門都投入巨資支持本領域的開發研究工作。

常見的是植物、動物以及微生物反應器，這幾種的應用都比較廣泛，也各有優缺點。在微生物反應器中真核生物蛋白質翻譯后加工的精確性有限。 細菌發酵常形成不溶聚合物，下游加工成加。而植物反應器上游生產成本(包括發酵生產)較低。 轉基因植物自交后得到的同質后代導致新遺傳性狀的穩定遺傳。動物反應器發酵需要昂貴的培養基，并且轉基因動物易產生公共和倫理問題。

總結

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