能否简单介绍一下全外显子测序服务的流程呢?
生活随笔
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能否简单介绍一下全外显子测序服务的流程呢?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
第一步基因測序:對人體內所有編碼蛋白質的基因進行測序。第二步數據分析:要求研究人員去判斷每個突變,搜索已出版的文獻和數據庫,找出最有可能導致病癥的突變。
如樓上所說,主要是測序和分析兩大步,我再稍微細化下:首先,測序前需要對物種的全外顯子進行捕獲,現在可用的試劑盒一般是一些模式物種的,包括人、小鼠、大鼠、玉米之類的;其次針對捕獲到的全外顯子進行高覆蓋度測序,一般測序深度要達到40×以上;再次對拿到的測序數據進行分析,如果研究物種是人類,一般要利用dbSNP數據庫篩選出非常見突變,然后再針對病人數據和對照組正常人數據進行比較,并進行疾病SNP的關聯,關聯分析一般是全外顯子測序的重要分析步驟,也是有希望找到致病突變的根本步驟。
如樓上所說,主要是測序和分析兩大步,我再稍微細化下:首先,測序前需要對物種的全外顯子進行捕獲,現在可用的試劑盒一般是一些模式物種的,包括人、小鼠、大鼠、玉米之類的;其次針對捕獲到的全外顯子進行高覆蓋度測序,一般測序深度要達到40×以上;再次對拿到的測序數據進行分析,如果研究物種是人類,一般要利用dbSNP數據庫篩選出非常見突變,然后再針對病人數據和對照組正常人數據進行比較,并進行疾病SNP的關聯,關聯分析一般是全外顯子測序的重要分析步驟,也是有希望找到致病突變的根本步驟。
總結
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