以往利用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽和芯片技術(shù)的研究表明,在酵母、果蠅和人類的基因組中有許多新的轉(zhuǎn)錄區(qū)存在。但是由于交叉雜交,芯片結(jié)果的準(zhǔn)確性是不確定的,RNA-Seq不受背景噪音問題的困擾,已證實(shí)至少75%,也許大于90%的釀酒酵母和栗酒裂殖酵母的基因組表達(dá)。此外,RNA-Seq結(jié)果表明,在每一個(gè)檢測的基因組中都存在大量的新轉(zhuǎn)錄區(qū)域,包括釀酒酵母、栗酒裂殖酵母、擬南芥、水稻、小鼠、人、和人體白色念珠菌等基因組。在釀酒酵母和栗酒裂殖酵母中分別發(fā)現(xiàn)了487個(gè)和453個(gè)新轉(zhuǎn)錄本,其中釀酒酵母的新轉(zhuǎn)錄本中有一半用芯片技術(shù)沒有鑒定出來。在水稻中檢測出的7232個(gè)新轉(zhuǎn)錄區(qū),其大部分轉(zhuǎn)錄水平都低于已知的cDNA基因。

總結(jié)

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