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国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列

發(fā)布時間:2023/11/21 综合教程 32 生活家
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.

澎湃新聞記者 賀梨萍

國家基因組科學數(shù)據(jù)中心(NGDC)信息顯示,1月26日,該中心收錄了由中國醫(yī)學科學院/北京協(xié)和醫(yī)學院病原生物學研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。

這是自2019年12月該病爆發(fā)以來,國內(nèi)公共數(shù)據(jù)平臺首次公開發(fā)布數(shù)據(jù)。此前科學家陸續(xù)獲得的2019新型冠狀病毒基因組序列一般遞交到全球流感序列數(shù)據(jù)庫(GISAID)和美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)的GenBank數(shù)據(jù)庫。

此前的1月22日,國家基因組科學數(shù)據(jù)中心正式發(fā)布2019新型冠狀病毒信息庫。該庫整合了世界衛(wèi)生組織(WHO)、中國疾病預防控制中心(CDC)、美國國家生物技術(shù)信息中心、全球流感序列數(shù)據(jù)庫等機構(gòu)公開發(fā)布的冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)、元信息、學術(shù)文獻、新聞動態(tài)、科普文章。同時,對不同冠狀病毒株的基因組序列做了變異分析與展示。

2019新型冠狀病毒信息庫基于不同參考基因組序列開展2019-nCoV病毒株基因組變異分析,并對結(jié)果進行了統(tǒng)計與可視化展示。通過對全基因組序列相似性比較和變異位點分析,獲取2019-nCoV病毒株之間、2019-nCoV病毒株與SARS冠狀病毒以及與類SARS冠狀病毒蝙蝠株之間的變異程度、變異區(qū)域、變異堿基的詳細信息。

對2019-nCoV病毒株的基因組變異分析為追溯病毒來源、追蹤病毒株變異路徑、防控新型冠狀病毒引發(fā)的疫情、治療病毒性肺炎提供重要的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)與決策支持。

上述資源庫發(fā)布之際,中科院北京基因組所研究員、國家基因組科學數(shù)據(jù)中心主任鮑一明在接受《中國科學報》采訪時曾表示,“我們這個數(shù)據(jù)庫發(fā)布以后,就有單位聯(lián)系要將武漢新型冠狀病毒基因組的數(shù)據(jù)送到這兒來,而不是先到國外然后國內(nèi)研究人員再去拿回來‘出口轉(zhuǎn)內(nèi)銷’了。”

國家基因組科學數(shù)據(jù)中心介紹,冠狀病毒屬于套式病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒屬,是一類具有囊膜、基因組為線性單股正鏈的RNA病毒,是自然界廣泛存在的一大類病毒。某些冠狀病毒會感染人類并引起疾病,比如中東呼吸綜合征(MERS)和嚴重急性呼吸綜合征(SARS),其癥狀可從普通感冒到重癥肺部感染。

總結(jié)

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