寫在前面

感謝喬兄送測的公司，讓我終于所有營業

part1講下怎么解決小問題

part2分享談判過程

part3mark張兄的奶茶

PART1 linux下批量修改文件后綴名以及合并多行

近期師兄在做高通量篩菌的工作

這兩天從公司返回了結果

大概是這樣一些文件的集合

其中.seq文件是后面分析要用的

但是這些seq文件中存在一些問題

有的文件總序列是多行的

而師兄后續要使用的是單行的

因此需要把多行的數據合并成單行的，同時還希望把.seq修改為.txt

OK GO!

其實代碼挺簡單的，循環的思路跟我之間寫過的wdnm.sh是一樣的

? # 單個樣品中的嘗試

#cp 84-J238-3-1_27F_TSS20201125-025-7163_D10.seq 84-J238-3-1_27F_TSS20201125-025-7163_D10.txt

## 此處替換\r是因為使用cat -A 發現師兄的文件中的換行符是win系統下的換行符，是\r\n，所以需要刪掉\r來使其變成linux下的換行符

#sed -i 's/\r//g' 84-J238-3-1_27F_TSS20201125-025-7163_D10.txt

#echo `tr -d "\n"? <84-J238-3-1_27F_TSS20201125-025-7163_D10.txt ` >84-J238-3-1_27F_TSS20201125-025-7163_D10.txt

#--------------------------批量樣本的處理--------------------

# 獲得seq文件的列表

ls *.seq > count.list

?# 把.seq去掉，獲取seq文件的名字

sed 's/.seq//g' count.list > txt.list

# 通過循環來處理每一個文件

for i in `cat txt.list` ;do

? cp ${i}.seq? ${i}.txt

? sed -i 's/\r//g' ${i}.txt

? echo `tr -d "\n"? ${i}.txt

done

# 刪除多余的文件

rm *.list

最后保存腳本修改下權限和加入環境中就可以使用了

直接在有seq文件的路徑下運行該腳本即可

腳本可以使用下面的代碼下載

wget https://raw.githubusercontent.com/Xuyifei-NAU/MyScript/main/jiojio.sh

part2 談判

part3 《張兄的奶茶》

寫在后面

這個腳本其實也不難，但是還是花了挺長時間，一方面是因為linux的命令忘了好多了，另一方面之前學的也不扎實，比如用sed死活替換不了結尾的換行符，tr的結果直接覆蓋源文件的時候總會把源文件變成空文件，${i}提取名字的時候，一直報錯，想了好久才發現，在設置循環值的時候就出現了問題……太難了

值得慶幸的是，但是思路還是很清晰的，并且實現了想要的功能(沒有因為很多不符合預想的輸出而放棄)

白天聽完博士和碩士的開題，感覺大家真的太強了，不管是實驗還是分析

自己這求學之路，不知道1%走完了沒……

預祝狒狒姐明天答辯順利

晚安

總結

以上是生活随笔為你收集整理的linux sed给空文件首行插入_linux下批量修改文件后缀名以及合并多行的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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