Mac 安裝relion 步驟

1， 使用terminal安裝brew（網(wǎng)址：https://brew.sh/index_zh-cn）

命令如下/usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"

2，安裝brew caskroom Homebrew-cask 相當(dāng)于 Homebrew 的擴(kuò)展，區(qū)別在于，brew 命令首先獲取程序源碼然后編譯安裝（包括依賴庫），并自動(dòng)做好必要的配置（如環(huán)境變量等）；而 brew cask 命令是下載已經(jīng)編譯好的應(yīng)用包并放在統(tǒng)一的目錄中。安裝好 Homebrew 后，可使用 brew tap caskroom/cask 命令直接安裝 Homebrew-cask

3， 安裝git 命令 $ brew install git

4, 緊接著有的電腦中包含developer tools 有的不包含，如果不包含，請(qǐng)?jiān)谌缦戮W(wǎng)址安裝。http://osxdaily.com/2014/02/12/install-command-line-tools-mac-os-x/

4， 另外一個(gè)必須安裝的東西是Xquarts,Xquarts 如果沒安裝從以下網(wǎng)址下載https://www.xquartz.org/

6，準(zhǔn)備工作完成以后，按照以下命令，先安裝cmake。如果直接按照原始的relion命令安裝會(huì)發(fā)現(xiàn)缺少mpi。但安裝面皮又會(huì)發(fā)現(xiàn)缺少gcc。所以搜了很久，感謝Kastritis Laboratory 貢獻(xiàn)的代碼，解決了我的問題。

5， brew install cmake 6， brew install gcc 7， brew install openmpi 8， brew install fltk 9， brew install fftw 10，###Set the correct compilers 11，export CXX=g++-9 12，export CC=gcc-9 13，export OMPI_CXX=g++-9 14，export OMPI_CC=gcc-9 15，export PATH="/usr/local/opt/openmpi/bin:${PATH}" 16，export CXXFLAGS="-I/usr/local/opt/openmpi/include" 17，export LDFLAGS="-L/usr/local/opt/openmpi/lib" 18，###Now download, compile and install relion 19，git clone https://github.com/3dem/relion.git 20，cd relion 21，git checkout 3.0.6 22，mkdir -p build 23，cd build 24，cmake .. 25，make -j 6 26，make install

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的mac brew 安装_无用技能之 Mac 安装relion 步骤的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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