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编程问答

java读取dcm影像文件_使用dcmtk库读取.dcm文件并获取信息+使用OpenCV显示图像

發布時間:2025/4/5 编程问答 62 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 java读取dcm影像文件_使用dcmtk库读取.dcm文件并获取信息+使用OpenCV显示图像 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

借助VS2013和OpenCV的繪圖功能,在工程DICOMReader.sln中實現了對單張.dcm圖像的讀取與顯示,以下是詳細步驟。

前期準備工作

編譯器:VS2013

庫:dcmtk-3.6.0(已編譯)、OpenCV

配置方法:

【項目屬性頁】-【VC++ 目錄】-【包含目錄】&【庫目錄】,加入如下文件夾

庫目錄

包含目錄

對于OpenCV的配置,還需要在【我的電腦】-【屬性】-【高級系統設置】-【環境變量】中的“path”中添加OpenCV的“bin”文件夾(如果沒有path,可以手動添加,至于系統變量還是用戶變量,沒有太大關系)

:…\opencv\build\x86\vc12\bin;

(在win7的系統上配置過的環境變量似乎不能立刻生效,運行程序的時候還是會提示“未能正確安裝xxx.dll鏈接庫”之類的話,重啟后可解決該問題)

最后,在【鏈接器】-【輸入】-【附加依賴項】添加如下鏈接庫:

netapi32.lib

wsock32.lib

ofstd.lib

oflog.lib

dcmimgle.lib

ijg8.lib

ijg12.lib

ijg16.lib

dcmdata.lib

dcmimage.lib

dcmnet.lib

opencv_core2413d.lib

opencv_features2d2413d.lib

opencv_flann2413d.lib

opencv_highgui2413d.lib

頭文件寫法:

#include "dcmtk/dcmdata/dctk.h"

#include "dcmtk/dcmimgle/dcmimage.h"

#include "dcmtk/dcmdata/dcfilefo.h"

#include

using namespace std;

讀取文件并獲取相關信息

在dcmtk庫中,包含了一個DcmFileFormat類,用來對原始.dcm文件進行操作,具體用法如下:

加載文件

DcmFileFormat dfile;

//文件路徑

string afile = "...\\**.dcm";

OFCondition result = dfile.loadFile(path.c_str()); // 加載文件

if (result.bad())

return ERROR;

// 功能函數如上方的loadFile,調用后會返回一個OFCondition類型的數據

// 可以過該類的成員函數bad()函數檢測是否調用成功

獲取文件相關信息

.dcm文件里面的數據結構大致如下:

簡單來說,一個.dcm格式的文件中,包含了一個數據集(Data set),由如下代碼獲取這個數據集:

DcmDataset *data = dfile.getDataset();

而DcmFileFormat類的構造函數,也允許由一個數據集(Data set)創建一個對象:

DcmFileFormat(); // default constructor

DcmFileFormat(DcmDataset *dataset); // using dataset

DcmFileFormat(const DcmFileFormat &old); // copy constructor

.dcm文件就像一個容器,而數據集才是真正的內容。

在數據集(Data set)中,包含了文件的元信息(Meta Information,存儲了被封裝數據集的標識信息)以及數據元素(Data Element);通過調用相應的函數來獲取文件的元信息以及數據集,代碼如下:

DcmMetaInfo *Metalnfo = dfile.getMetaInfo(); // 文件元信息

DcmTag Tag = Metalnfo->getTag(); // 從元信息中獲取標簽

DcmDataset *data = dfile.getDataset(); // 數據集

DcmElement *element = NULL;

result = data->findAndGetElement(DCM_PixelData, element);

if (result.bad())

return ERROR;

需要特別注意的是:

創建數據元素對象的時候,最好給其賦值為NULL,以免初始值指向未知的地址;

findAndGetElement(DCM_PixelData, element);該函數用來獲取數據元素,函數中的第一個參數“DCM_PixelData”為用戶想要從數據集中獲取的數據元素類型,具體的元素類型可以參考頭文件“dcdeftag.h”。(共有3250種參數類型)

數據元素(Data Element)從邏輯上說就是數據集(Data set)的一個子集,因此,通常來說,通過“findAndGetElement()”函數獲得的數據元素會比數據集的長度來的小,可以通過如下方式進行檢測:

Uint32 data_len = data->getLength();

Uint32 element_len = element->getLength();

cout << "data_len " << data_len << endl;

cout << "elemetn_len " << element_len << endl;

獲取數據元素(Data Element)只是將數據集(Data set)中的我們感興趣的部分存儲到了由類DcmElement創建的對象里面,那么自然地,我們會想到數據的可視化,這將采取另一種處理方式:

dcmtk庫中包含了類“OFString”,這只是一個簡單的字符串類,它實現了std的一個子集::string;我們通過函數“findAndGetOFString()”來獲取我們要的數據項,并將其保存在類OFString創建的對象中,以此來實現數據可視化。具體代碼如下:

OFString PatientName;

data->findAndGetOFString(DCM_PatientName, PatientName);

cout << "PatientName: " << PatientName<< endl;

圖像的顯示

由之前的代碼:

DcmElement *element = NULL;

result = data->findAndGetElement(DCM_PixelData, element);

if (result.bad())

return ERROR;

獲取了圖像的像素數據,進行進一步的操作:

Uint16* pixData16;

result = element->getUint16Array(pixData16);

if (result.bad())

return ERROR;

由數據元素(Data Element)的成員函數getUint16Array()將對應的像素數據存儲到無符號整型(unsigned short,即Uint16,又稱無符號16位整型)數組中,獲得一個向量;再借助OpenCV的創建矩陣和顯示圖像的功能,進行圖像的顯示:

for (int i = 0; i < 512*512; i++)

*(pixData16 + i) *= 20; // 灰度拉伸

cv::Mat imag = cv::Mat(512, 512, CV_16U, pixData16);

cv::imshow("image", imag);

cv::waitKey();

在創建矩陣之前,進行了灰度拉伸,以提升顯示的亮度。

最終效果如上。現在有個問題,在進行數據拉伸的時候,預先已經知道了CT圖像的行列值的大小,而應該利用哪個參數或者函數來獲取圖像的size呢?

總結

以上是生活随笔為你收集整理的java读取dcm影像文件_使用dcmtk库读取.dcm文件并获取信息+使用OpenCV显示图像的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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