日韩性视频-久久久蜜桃-www中文字幕-在线中文字幕av-亚洲欧美一区二区三区四区-撸久久-香蕉视频一区-久久无码精品丰满人妻-国产高潮av-激情福利社-日韩av网址大全-国产精品久久999-日本五十路在线-性欧美在线-久久99精品波多结衣一区-男女午夜免费视频-黑人极品ⅴideos精品欧美棵-人人妻人人澡人人爽精品欧美一区-日韩一区在线看-欧美a级在线免费观看

歡迎訪問(wèn) 生活随笔!

生活随笔

當(dāng)前位置: 首頁(yè) > 编程资源 > 编程问答 >内容正文

编程问答

bioperl 格式化genebank的输出

發(fā)布時(shí)間:2025/3/21 编程问答 21 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 bioperl 格式化genebank的输出 小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

代碼如下:

use Bio::SeqIO; use Bio::DB::GenBank; use Bio::DB::Query::GenBank;
my $db_obj = Bio::DB::GenBank->new; my $seq_obj = $db_obj->get_Seq_by_acc('JN093905'); my $id = $seq_obj->display_id(); my $organ; foreach my $feat_object ($seq_obj->get_SeqFeatures) {if ($feat_object->primary_tag eq "source") {($organ) = $feat_object->get_tag_values('organism');}if ($feat_object->primary_tag eq "CDS") {my ($gene_name) = $feat_object->get_tag_values('gene');next if $gene_name ne 'nifH';my ($seq) = $feat_object->get_tag_values('translation');my ($pro) = $feat_object->get_tag_values('product');$seq = lc($seq);my $len = (length($seq) + 1) * 3;print qq{>$id coded_by=<1..>$len,organism=$organ,definition=$pro\n$seq\n};} }

運(yùn)行結(jié)果如下:

>JN093905 coded_by=<1..>330,organism=uncultured Trichodesmium sp.,definition=dinitrogenase reductase rlilnakaqttvlhvaaergavedveldevlkpgfggikcvesggpepgvgcagrgiitainfleeegaytdldfvsydvlgdvvcggfampirenkaqeiyivcsgem

?

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的bioperl 格式化genebank的输出的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò),歡迎將生活随笔推薦給好友。

主站蜘蛛池模板: 亚洲网视频 | 在线午夜视频 | 特级西西444www高清大视频 | 日日摸夜夜添夜夜 | 欧美日韩久久久久 | 日本wwwwww | 手机福利视频 | 精品欧美 | 亚洲欧美精品suv | 欧美大片高清 | 国产熟妇一区二区三区aⅴ网站 | 欧洲精品一区二区三区久久 | 粉豆av| 在线观看中文 | 婷婷伊人五月天 | 日本精品久久久久中文字幕 | 日韩免费视频一区二区 | 在线观看国产三级 | 国内精品久久久久久 | 超碰人人国产 | 91免费进入| av小片 | 国产欲妇 | 污污视频在线免费看 | 村上里沙番号 | 黄色三级视屏 | 久久视频国产 | 国产精品久久久久久一区二区 | 久一区二区三区 | av视屏| 国产乱码精品一区二区三区中文 | 鲁一鲁色一色 | 欧美 日韩 国产 中文 | 麻豆国产尤物av尤物在线观看 | 中文在线视频 | 男人阁久久 | 久久精品国产亚洲av蜜臀色欲 | 亚州av网站 | 99精品人妻无码专区在线视频区 | 亚洲美女久久 | 白浆在线| 99ri视频 | 国产深喉视频一区二区 | 先锋资源网av | 国产成人精品无码免费看夜聊软件 | 欧美夜夜骑 | 蜜乳av一区二区 | 色欲av无码一区二区三区 | 娇喘顶撞深初h1v1 | 欧美特级黄| 中文字幕天堂在线 | 欧美日韩一级在线观看 | 99精品视频在线观看免费 | 一级片毛片 | 91影音| 精品www久久久久久奶水 | 天天射天天舔 | 国产高清一级片 | 欧美成人精品欧美一级 | 国产五十路 | 欧美精品久久久久久久自慰 | 制服丝袜亚洲色图 | 日韩欧美国产电影 | 欧美理论片在线观看 | 97超视频在线观看 | 先锋影音在线 | 天天插天天干 | 久久亚洲精品无码va白人极品 | 91丨九色丨国产 | 毛片无遮挡高清免费观看 | 97成人在线 | 久久亚洲av无码精品色午夜麻豆 | 国产精品一区二区视频 | 玖玖视频国产 | 黄色av毛片 | 成人片黄网站色大片免费毛片 | 欧美日韩色综合 | 免费在线成人av | 人妻精品无码一区二区三区 | 亚洲一区二区三区在线看 | 日韩中文字幕久久 | 国产大片av | 91琪琪| 久久超碰av | 综合网中文字幕 | 中文字幕人妻一区二区在线视频 | 欧美另类视频在线 | 免费黄色看片 | 天躁夜夜躁狼狠躁 | 高清欧美精品xxxxx在线看 | 永久免费未满 | 99久精品视频 | 99精品亚洲| 午夜激情男女 | 四虎影视免费 | 国产日韩欧美精品在线观看 | 福利一区在线 | 国产91精品一区二区绿帽 | 日韩欧美一区在线 |