原F1000Prime推荐:ACE2泛癌分析图谱(TCGA数据库挖掘)
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新冠肺炎病毒來勢洶洶,成為一場席卷全球的突發公共衛生事件,通過臨床數據可知在新型冠狀肺炎尤其是重癥病例中,很多都是老年人或合并其他基礎疾病的患者,腫瘤患者由于自身處于免疫異常狀態,加之手術、放化療等治療造成免疫力進一步低下,更是易被這個“恃強凌弱”的病毒趁虛而入。然而惡性腫瘤類型繁多,何種惡性腫瘤患者更易感染腫瘤?其中可能存在何種生物分子機制?
為了解決該疑問,上海交大醫學院附屬第九人民醫院眼科柴佩韋博士和范先群教授首次繪制ACE2泛癌分析圖譜,揭示ACE2高表達的腫瘤患者更易罹患新冠肺炎,論文近期發表于Journal of hematology and oncology(《血液學與腫瘤學雜志》)(IF:8.731 ),并同期被列為網頁封面文章。
ACE2是人類血管緊張素轉換酶同源物,是一種鋅金屬蛋白酶,屬于1型跨膜蛋白,在病毒感染過程中,ACE2是新冠病毒的膜上結合受體,與病毒和宿主細胞的融合、入侵過程有關。也就是說,ACE2是新冠肺炎病毒感染的“導火線”。
研究人員利用cBioportal、UALCAN和gepia2等生物信息學分析工具,納入腫瘤基因組計劃(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數據庫中30余類惡性腫瘤,在10953例腫瘤患者中針對遺傳變異(拷貝數變異、突變等)、RNA表達、DNA甲基化、預后趨勢分析等方面進行研究,發現腫瘤中可出現ACE2突變、拷貝數異常擴增等多種遺傳學異常。同時,在結腸腺癌、腎乳頭狀細胞癌、胰腺癌、直腸腺癌、胃腺癌和肺腺癌等六種惡性腫瘤中ACE2表達顯著上調,并伴有ACE2啟動子區DNA甲基化異常。
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由于ACE2是新冠肺炎病毒結合的靶標蛋白,因此ACE2高表達的患者相對暴露風險增高,對新冠肺炎病毒更易感。該研究結論也與何建行教授、謝叢華教授團隊此前發表于《柳葉刀-腫瘤》的研究結果相一致(肺腺癌患者占總體患者比例高,癌癥是新冠肺炎感染的獨立危險因素)。
總的來說,研究提示一方面由于新冠病毒傳染性極強,且部分癌癥患者ACE2表達增高,癌癥患者應加強個人防護;另一方面若患有癌癥的患者感染新冠病毒,出現重癥、死亡的可能增高,應加強監測治療并優先處理。
研究人員也提到,由于本研究基于腫瘤患者隊列的生物信息學研究,因此僅起提示作用,相關結論仍需要后續大規模的臨床隊列研究證實。
值得一提的是,該研究于5月15日得到長期致力于腫瘤藥物研發的西印度大學醫學院教授Maxine Gossell-Williams教授的強力推薦,列為世界學術組織“Faculty Opinions”推薦論文,并進行點評,評價該研究為新冠肺炎的診療提供了有效參考模型。
Faculty Opinions(原F1000Prime,于2020年4月12日改名為Faculty Opinions)是國際生物醫學領域重要的學術論文評估機構,由全球近8000名生物學和醫學領域的頂尖科學家組成。“Faculty Opinions”中的科學家從每年所發表的生物醫學論文中評選出一小部分(不足千分之二)最重要的文章,推薦給全世界的生物學和醫學工作者,并對論文加以評論,研究論文能被Faculty Opinions點評與收錄,代表著該論文有較高的學術水平和重要的科學價值。
論文鏈接
https://jhoonline.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13045-020-00883-5(點擊閱讀原文直達)
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總結
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