對于RNA-seq的數據，之前我們的分析方法只是局限于單個基因之間的整合分析，最多也就是做一下富集這樣的聚類分析。前段時間隨著腫瘤免疫的熱度，也有人試著開始利用RNA-seq這樣的數據來評價患者的免疫情況。

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基本的過程也就是我們提供RNA-seq的數據。然后使用相對應的算法來評估每個樣本的免疫浸潤程度。51xxziyuan.com

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目前關于免疫浸潤的評估就有 TIMER, CIBERSORT, quanTIseq, xCell, MCP-counter等一些的算法，這些很多都是需要自己下載代碼來進行分析的。但是TIMER算法的作者，最近把TCGA所有癌癥的RNA-seq的基于不同算法的結果都進行了運算，同時也把結果放到了網站上，這樣我們就可以查各個算法當中具體的免疫情況。今天我們就來介紹一個TIMER 2.0這個數據庫。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的TCGA免疫浸润评价数据库，TIMER 2.0 使用指南的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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