LncRNADisease database数据库使用方法
LncRNADisese database
數(shù)據(jù)庫概覽
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進(jìn)入LncRNADisease database主頁(見文末),該數(shù)據(jù)庫收錄來自實驗結(jié)果支持的lncRNA與disease關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),以及蛋白、mRNA、miRNA和DNA等不同分子類型與lncRNA相互作用研究結(jié)果,包括結(jié)合、調(diào)控和共表達(dá)關(guān)系,所有數(shù)據(jù)均可供瀏覽或下載。
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當(dāng)前版本總共集成近3000個lncRNA分子與disease關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)條目,475個lncRNA交互條目。除外信息查詢功能,該數(shù)據(jù)庫還可以基于一個新的lncRNA基因組背景來預(yù)測其可能的相關(guān)疾病,建立新的lncRNA與disease關(guān)聯(lián)性,目前提供1564個人類lncRNAs對疾病的預(yù)測結(jié)果。
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主頁History提供既往數(shù)據(jù)庫更新信息,目前最新版本為2019年1月份更新的LncRNADisease 2.0版本,在Links處點擊鏈接進(jìn)入,2.0版新增實驗結(jié)果支持的circRNA與疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),提供ncRNA、mRNA和miRNA之間調(diào)控關(guān)系數(shù)據(jù),并為每個lncRNA與疾病關(guān)聯(lián)條目提供置信評分。
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該版本目前涵蓋19166個LncRNAs和823個circRNAs與529種疾病之間,總計205959個LncRNA-disease關(guān)聯(lián)條目和1004個circRNA-disease關(guān)聯(lián)條目以及2297個LncRNA和198個circRNA病因?qū)W條目,物種包括人、大鼠、小鼠和雞等。
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點擊Browse,預(yù)覽該數(shù)據(jù)庫收錄的lncRNA信息和疾病信息:左側(cè)欄lncRNA條目下任選一個點擊進(jìn)入,第一個表格提供該lncRNA詳細(xì)信息,包括名稱,染色體位置,基因組起止位點,DNA鏈,別名,Genbank鏈接,以及Gene序列和RNA序列信息。
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總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的LncRNADisease database数据库使用方法的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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