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【Python】pandas 缺失数据处理大全(附代码)

發布時間:2025/3/12 python 37 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 【Python】pandas 缺失数据处理大全(附代码) 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

之前一直在分享pandas的一些騷操作:pandas騷操作,根據大家反映還不錯,但是很多技巧都混在了一起,沒有細致的分類,這樣不利于查找,也不成體系。

利用閑暇之余將有關數據清洗、數據分析的一些技能再次進行分類,里面也包含了我平時用到的一些小技巧,此次就從數據清洗缺失值處理走起,鏈接:pandas數據清洗,關注這個話題可第一時間看到更新。

所有數據和代碼可在我的GitHub獲取:

https://github.com/xiaoyusmd/PythonDataScience

一、缺失值類型

在pandas中,缺失數據顯示為NaN。缺失值有3種表示方法,np.nan,none,pd.NA。

1、np.nan

缺失值有個特點(坑),它不等于任何值,連自己都不相等。如果用nan和任何其它值比較都會返回nan。

np.nan?==?np.nan >>?False

也正由于這個特點,在數據集讀入以后,不論列是什么類型的數據,默認的缺失值全為np.nan。

因為nan在Numpy中的類型是浮點,因此整型列會轉為浮點;而字符型由于無法轉化為浮點型,只能歸并為object類型('O'),原來是浮點型的則類型不變。

type(np.nan) >>?floatpd.Series([1,2,3]).dtype >>?dtype('int64') pd.Series([1,np.nan,3]).dtype >>?dtype('float64')

初學者做數據處理遇見object類型會發懵,不知道這是個啥,明明是字符型,導入后就變了,其實是因為缺失值導致的。

除此之外,還要介紹一種針對時間序列的缺失值,它是單獨存在的,用NaT表示,是pandas的內置類型,可以視為時間序列版的np.nan,也是與自己不相等。

s_time?=?pd.Series([pd.Timestamp('20220101')]*3) s_time >>?0?2022-01-011?2022-01-012?2022-01-01dtype:datetime64[ns] ----------------- s_time[2]?=?pd.NaT s_time >>?0?2022-01-011?2022-01-012?NaTdtype:datetime64[ns]

2、None

還有一種就是None,它要比nan好那么一點,因為它至少自己與自己相等。

None?==?None >>?True

在傳入數值類型后,會自動變為np.nan。

type(pd.Series([1,None])[1]) >>?numpy.float64

只有當傳入object類型時是不變的,因此可以認為如果不是人工命名為None的話,它基本不會自動出現在pandas中,所以None大家基本也看不到。

type(pd.Series([1,None],dtype='O')[1]) >>?NoneType

3、NA標量

pandas1.0以后的版本中引入了一個專門表示缺失值的標量pd.NA,它代表空整數、空布爾值、空字符,這個功能目前處于實驗階段。

開發者也注意到了這點,對于不同數據類型采取不同的缺失值表示會很亂。pd.NA就是為了統一而存在的。pd.NA的目標是提供一個缺失值指示器,可以在各種數據類型中一致使用(而不是np.nan、None或者NaT分情況使用)。

s_new?=?pd.Series([1,?2],?dtype="Int64") s_new >>?0???11???2dtype:?Int64 ----------------- s_new[1]?=?pd.NaT s_new >>?0????11??<NA>dtype:?Int64

同理,對于布爾型、字符型一樣不會改變原有數據類型,這樣就解決了原來動不動就變成object類型的麻煩了。

下面是pd.NA的一些常用算術運算和比較運算的示例:

#####?算術運算 #?加法 pd.NA?+?1 >>?<NA> ----------- #?乘法 "a"?*?pd.NA >>?<NA> ----------- #?以下兩種其中結果為1 pd.NA?**?0 >>?1 ----------- 1?**?pd.NA >>?1#####?比較運算 pd.NA?==?pd.NA >>?<NA> ----------- pd.NA?<?2.5 >>?<NA> ----------- np.log(pd.NA) >>?<NA> ----------- np.add(pd.NA,?1) >>?<NA>

二、缺失值判斷

了解了缺失值的幾種形式后,我們要知道如何判斷缺失值。對于一個dataframe而言,判斷缺失的主要方法就是isnull()或者isna(),這兩個方法會直接返回True和False的布爾值。可以是對整個dataframe或者某個列。

df?=?pd.DataFrame({'A':['a1','a1','a2','a3'],'B':['b1',None,'b2','b3'],'C':[1,2,3,4],'D':[5,None,9,10]}) #?將無窮設置為缺失值?????? pd.options.mode.use_inf_as_na?=?True

1、對整個dataframe判斷缺失

df.isnull() >>?A?B?C?D 0?False?False?False?False 1?False?True?False?True 2?False?False?False?False 3?False?False?False?False

2、對某個列判斷缺失

df['C'].isnull() >>?0????False1????False2????False3????False Name:?C,?dtype:?bool

如果想取非缺失可以用notna(),使用方法是一樣的,結果相反。

三、缺失值統計

1、列缺失

一般我們會對一個dataframe的進行缺失統計,查看每個列有多少缺失,如果缺失率過高再進行刪除或者插值等操作。那么直接在上面的isnull()返回的結果上直接應用.sum()即可,axis默認等于0,0是列,1是行。

##?列缺失統計 isnull().sum(axis=0)

2、行缺失

但是很多情況下,我們也需要對進行缺失值判斷。比如一行數據可能一個值都沒有,如果這個樣本進入模型,會造成很大的干擾。因此,行列兩個缺失率通常都要查看并統計。

操作很簡單,只需要在sum()中設置axis=1即可。

##?行缺失統計 isnull().sum(axis=1)

3、缺失率

有時我不僅想要知道缺失的數量,我更想知道缺失的比例,即缺失率。正常可能會想到用上面求得數值再比上總行數。但其實這里有個小技巧可以一步就實現。

##?缺失率 df.isnull().sum(axis=0)/df.shape[0]##?缺失率(一步到位) isnull().mean()

四、缺失值篩選

篩選需要loc配合完成,對于行和列的缺失篩選如下:

#?篩選有缺失值的行 df.loc[df.isnull().any(1)] >>?A?B?C?D 1?a1?None?2?NaN ----------------- #?篩選有缺失值的列 df.loc[:,df.isnull().any()] >>?B?D 0?b1?5.0 1?None?NaN 2?b2?9.0 3?b3?10.0

如果要查詢沒有缺失值的行和列,可以對表達式用取反~操作:

df.loc[~(df.isnull().any(1))] >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

上面使用了any判斷只要有缺失就進行篩選,也可以用all判斷是否全部缺失,同樣可以對行里進行判斷,如果整列或者整行都是缺失值,那么這個變量或者樣本就失去了分析的意義,可以考慮刪除。

五、缺失值填充

一般我們對缺失值有兩種處理方法,一種是直接刪除,另外一種是保留并填充。下面先介紹填充的方法fillna。

#?將dataframe所有缺失值填充為0 df.fillna(0) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?0?2?0.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0 -------------- #?將D列缺失值填充為-999 df.D.fillna('-999') >>?0???????51????-9992???????93??????10 Name:?D,?dtype:?object

方法很簡單,但使用時需要注意一些參數。

  • inplace:可以設置fillna(0, inplace=True)來讓填充生效,原dataFrame被填充。

  • methond:可以設置methond方法來實現向前或者向后填充,pad/ffill為向前填充,bfill/backfill為向后填充,比如df.fillna(methond='ffill'),也可以簡寫為df.ffill()。

df.ffill() >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?b1?2?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

原缺失值都會按照前一個值來填充(B列1行,D列1行)。

除了用前后值來填充,也可以用整個列的均值來填充,比如對D列的其它非缺失值的平均值8來填充缺失值。

df.D.fillna(df.D.mean()) >>?0?????5.01?????8.02?????9.03????10.0 Name:?D,?dtype:?float64

六、缺失值刪除

刪除缺失值也非情況,比如是全刪除還是刪除比較高缺失率,這個要看自己的容忍程度,真實的數據必然會存在缺失的,這個無法避免。而且缺失在某些情況下也代表了一定的含義,要視情況而定。

1、全部直接刪除

#?全部直接刪除 df.dropna() >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

2、行缺失刪除

#?行缺失刪除 df.dropna(axis=0) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

3、列缺失刪除

#?列缺失刪除 df.dropna(axis=1) >>?A?C 0?a1?1 1?a1?2 2?a2?3 3?a3?4 ------------- #?刪除指定列范圍內的缺失,因為C列無缺失,所以最后沒有變化 df.dropna(subset=['C']) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?None?2?NaN 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

4、按缺失率刪除

這個可以考慮用篩選的方法來實現,比如要刪除列缺失大于0.1的(即篩選小于0.1的)。

df.loc[:,df.isnull().mean(axis=0)?<?0.1] >>?A?C 0?a1?1 1?a1?2 2?a2?3 3?a3?4 ------------- #?刪除行缺失大于0.1的 df.loc[df.isnull().mean(axis=1)?<?0.1] >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0

七、缺失值參與計算

如果不對缺失值處理,那么缺失值會按照什么邏輯進行計算呢?

下面我們一起看一下各種運算下缺失值的參與邏輯。

1、加法

df >>A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?None?2?NaN 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0 --------------- #?對所有列求和 df.sum() >>?A????a1a1a2a3C??????????10D??????????24

可以看到,加法是會忽略缺失值的。

2、累加

#?對D列進行累加 df.D.cumsum() >>?0?????5.01?????NaN2????14.03????24.0 Name:?D,?dtype:?float64 --------------- df.D.cumsum(skipna=False) >>?0????5.01????NaN2????NaN3????NaN Name:?D,?dtype:?float64

cumsum累加會忽略NA,但值會保留在列中,可以使用skipna=False跳過有缺失值的計算并返回缺失值。

3、計數

#?對列計數 df.count() >>?A????4B????3C????4D????3 dtype:?int64

缺失值不進入計數范圍里。

4、聚合分組

df.groupby('B').sum() >>?C?D B?? b1?1?5.0 b2?3?9.0 b3?4?10.0 --------------- df.groupby('B',dropna=False).sum() >>?C?D B?? b1?1?5.0 b2?3?9.0 b3?4?10.0 NaN?2?0.0

聚合時會默認忽略缺失值,如果要缺失值計入到分組里,可以設置dropna=False。這個用法和其它比如value_counts是一樣的,有的時候需要看缺失值的數量。

以上就是所有關于缺失值的常用操作了,從理解缺失值的3種表現形式開始,到缺失值判斷、統計、處理、計算等。

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參考:

[1]深入淺出pandas

[2]https://mp.weixin.qq.com/s/Ool5T49RxYj-Os4DWzTeyQ

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的【Python】pandas 缺失数据处理大全(附代码)的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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