【Python】pandas 缺失数据处理大全(附代码)
之前一直在分享pandas的一些騷操作:pandas騷操作,根據大家反映還不錯,但是很多技巧都混在了一起,沒有細致的分類,這樣不利于查找,也不成體系。
利用閑暇之余將有關數據清洗、數據分析的一些技能再次進行分類,里面也包含了我平時用到的一些小技巧,此次就從數據清洗缺失值處理走起,鏈接:pandas數據清洗,關注這個話題可第一時間看到更新。
所有數據和代碼可在我的GitHub獲取:
https://github.com/xiaoyusmd/PythonDataScience
一、缺失值類型
在pandas中,缺失數據顯示為NaN。缺失值有3種表示方法,np.nan,none,pd.NA。
1、np.nan
缺失值有個特點(坑),它不等于任何值,連自己都不相等。如果用nan和任何其它值比較都會返回nan。
np.nan?==?np.nan >>?False也正由于這個特點,在數據集讀入以后,不論列是什么類型的數據,默認的缺失值全為np.nan。
因為nan在Numpy中的類型是浮點,因此整型列會轉為浮點;而字符型由于無法轉化為浮點型,只能歸并為object類型('O'),原來是浮點型的則類型不變。
type(np.nan) >>?floatpd.Series([1,2,3]).dtype >>?dtype('int64') pd.Series([1,np.nan,3]).dtype >>?dtype('float64')初學者做數據處理遇見object類型會發懵,不知道這是個啥,明明是字符型,導入后就變了,其實是因為缺失值導致的。
除此之外,還要介紹一種針對時間序列的缺失值,它是單獨存在的,用NaT表示,是pandas的內置類型,可以視為時間序列版的np.nan,也是與自己不相等。
s_time?=?pd.Series([pd.Timestamp('20220101')]*3) s_time >>?0?2022-01-011?2022-01-012?2022-01-01dtype:datetime64[ns] ----------------- s_time[2]?=?pd.NaT s_time >>?0?2022-01-011?2022-01-012?NaTdtype:datetime64[ns]2、None
還有一種就是None,它要比nan好那么一點,因為它至少自己與自己相等。
None?==?None >>?True在傳入數值類型后,會自動變為np.nan。
type(pd.Series([1,None])[1]) >>?numpy.float64只有當傳入object類型時是不變的,因此可以認為如果不是人工命名為None的話,它基本不會自動出現在pandas中,所以None大家基本也看不到。
type(pd.Series([1,None],dtype='O')[1]) >>?NoneType3、NA標量
pandas1.0以后的版本中引入了一個專門表示缺失值的標量pd.NA,它代表空整數、空布爾值、空字符,這個功能目前處于實驗階段。
開發者也注意到了這點,對于不同數據類型采取不同的缺失值表示會很亂。pd.NA就是為了統一而存在的。pd.NA的目標是提供一個缺失值指示器,可以在各種數據類型中一致使用(而不是np.nan、None或者NaT分情況使用)。
s_new?=?pd.Series([1,?2],?dtype="Int64") s_new >>?0???11???2dtype:?Int64 ----------------- s_new[1]?=?pd.NaT s_new >>?0????11??<NA>dtype:?Int64同理,對于布爾型、字符型一樣不會改變原有數據類型,這樣就解決了原來動不動就變成object類型的麻煩了。
下面是pd.NA的一些常用算術運算和比較運算的示例:
#####?算術運算 #?加法 pd.NA?+?1 >>?<NA> ----------- #?乘法 "a"?*?pd.NA >>?<NA> ----------- #?以下兩種其中結果為1 pd.NA?**?0 >>?1 ----------- 1?**?pd.NA >>?1#####?比較運算 pd.NA?==?pd.NA >>?<NA> ----------- pd.NA?<?2.5 >>?<NA> ----------- np.log(pd.NA) >>?<NA> ----------- np.add(pd.NA,?1) >>?<NA>二、缺失值判斷
了解了缺失值的幾種形式后,我們要知道如何判斷缺失值。對于一個dataframe而言,判斷缺失的主要方法就是isnull()或者isna(),這兩個方法會直接返回True和False的布爾值。可以是對整個dataframe或者某個列。
df?=?pd.DataFrame({'A':['a1','a1','a2','a3'],'B':['b1',None,'b2','b3'],'C':[1,2,3,4],'D':[5,None,9,10]}) #?將無窮設置為缺失值?????? pd.options.mode.use_inf_as_na?=?True1、對整個dataframe判斷缺失
df.isnull() >>?A?B?C?D 0?False?False?False?False 1?False?True?False?True 2?False?False?False?False 3?False?False?False?False2、對某個列判斷缺失
df['C'].isnull() >>?0????False1????False2????False3????False Name:?C,?dtype:?bool如果想取非缺失可以用notna(),使用方法是一樣的,結果相反。
三、缺失值統計
1、列缺失
一般我們會對一個dataframe的列進行缺失統計,查看每個列有多少缺失,如果缺失率過高再進行刪除或者插值等操作。那么直接在上面的isnull()返回的結果上直接應用.sum()即可,axis默認等于0,0是列,1是行。
##?列缺失統計 isnull().sum(axis=0)2、行缺失
但是很多情況下,我們也需要對行進行缺失值判斷。比如一行數據可能一個值都沒有,如果這個樣本進入模型,會造成很大的干擾。因此,行列兩個缺失率通常都要查看并統計。
操作很簡單,只需要在sum()中設置axis=1即可。
##?行缺失統計 isnull().sum(axis=1)3、缺失率
有時我不僅想要知道缺失的數量,我更想知道缺失的比例,即缺失率。正常可能會想到用上面求得數值再比上總行數。但其實這里有個小技巧可以一步就實現。
##?缺失率 df.isnull().sum(axis=0)/df.shape[0]##?缺失率(一步到位) isnull().mean()四、缺失值篩選
篩選需要loc配合完成,對于行和列的缺失篩選如下:
#?篩選有缺失值的行 df.loc[df.isnull().any(1)] >>?A?B?C?D 1?a1?None?2?NaN ----------------- #?篩選有缺失值的列 df.loc[:,df.isnull().any()] >>?B?D 0?b1?5.0 1?None?NaN 2?b2?9.0 3?b3?10.0如果要查詢沒有缺失值的行和列,可以對表達式用取反~操作:
df.loc[~(df.isnull().any(1))] >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0上面使用了any判斷只要有缺失就進行篩選,也可以用all判斷是否全部缺失,同樣可以對行里進行判斷,如果整列或者整行都是缺失值,那么這個變量或者樣本就失去了分析的意義,可以考慮刪除。
五、缺失值填充
一般我們對缺失值有兩種處理方法,一種是直接刪除,另外一種是保留并填充。下面先介紹填充的方法fillna。
#?將dataframe所有缺失值填充為0 df.fillna(0) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?0?2?0.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0 -------------- #?將D列缺失值填充為-999 df.D.fillna('-999') >>?0???????51????-9992???????93??????10 Name:?D,?dtype:?object方法很簡單,但使用時需要注意一些參數。
inplace:可以設置fillna(0, inplace=True)來讓填充生效,原dataFrame被填充。
methond:可以設置methond方法來實現向前或者向后填充,pad/ffill為向前填充,bfill/backfill為向后填充,比如df.fillna(methond='ffill'),也可以簡寫為df.ffill()。
原缺失值都會按照前一個值來填充(B列1行,D列1行)。
除了用前后值來填充,也可以用整個列的均值來填充,比如對D列的其它非缺失值的平均值8來填充缺失值。
df.D.fillna(df.D.mean()) >>?0?????5.01?????8.02?????9.03????10.0 Name:?D,?dtype:?float64六、缺失值刪除
刪除缺失值也非情況,比如是全刪除還是刪除比較高缺失率,這個要看自己的容忍程度,真實的數據必然會存在缺失的,這個無法避免。而且缺失在某些情況下也代表了一定的含義,要視情況而定。
1、全部直接刪除
#?全部直接刪除 df.dropna() >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.02、行缺失刪除
#?行缺失刪除 df.dropna(axis=0) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.03、列缺失刪除
#?列缺失刪除 df.dropna(axis=1) >>?A?C 0?a1?1 1?a1?2 2?a2?3 3?a3?4 ------------- #?刪除指定列范圍內的缺失,因為C列無缺失,所以最后沒有變化 df.dropna(subset=['C']) >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?None?2?NaN 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.04、按缺失率刪除
這個可以考慮用篩選的方法來實現,比如要刪除列缺失大于0.1的(即篩選小于0.1的)。
df.loc[:,df.isnull().mean(axis=0)?<?0.1] >>?A?C 0?a1?1 1?a1?2 2?a2?3 3?a3?4 ------------- #?刪除行缺失大于0.1的 df.loc[df.isnull().mean(axis=1)?<?0.1] >>?A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0七、缺失值參與計算
如果不對缺失值處理,那么缺失值會按照什么邏輯進行計算呢?
下面我們一起看一下各種運算下缺失值的參與邏輯。
1、加法
df >>A?B?C?D 0?a1?b1?1?5.0 1?a1?None?2?NaN 2?a2?b2?3?9.0 3?a3?b3?4?10.0 --------------- #?對所有列求和 df.sum() >>?A????a1a1a2a3C??????????10D??????????24可以看到,加法是會忽略缺失值的。
2、累加
#?對D列進行累加 df.D.cumsum() >>?0?????5.01?????NaN2????14.03????24.0 Name:?D,?dtype:?float64 --------------- df.D.cumsum(skipna=False) >>?0????5.01????NaN2????NaN3????NaN Name:?D,?dtype:?float64cumsum累加會忽略NA,但值會保留在列中,可以使用skipna=False跳過有缺失值的計算并返回缺失值。
3、計數
#?對列計數 df.count() >>?A????4B????3C????4D????3 dtype:?int64缺失值不進入計數范圍里。
4、聚合分組
df.groupby('B').sum() >>?C?D B?? b1?1?5.0 b2?3?9.0 b3?4?10.0 --------------- df.groupby('B',dropna=False).sum() >>?C?D B?? b1?1?5.0 b2?3?9.0 b3?4?10.0 NaN?2?0.0聚合時會默認忽略缺失值,如果要缺失值計入到分組里,可以設置dropna=False。這個用法和其它比如value_counts是一樣的,有的時候需要看缺失值的數量。
以上就是所有關于缺失值的常用操作了,從理解缺失值的3種表現形式開始,到缺失值判斷、統計、處理、計算等。
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參考:
[1]深入淺出pandas
[2]https://mp.weixin.qq.com/s/Ool5T49RxYj-Os4DWzTeyQ
往期精彩回顧適合初學者入門人工智能的路線及資料下載中國大學慕課《機器學習》(黃海廣主講)機器學習及深度學習筆記等資料打印機器學習在線手冊深度學習筆記專輯《統計學習方法》的代碼復現專輯 AI基礎下載本站qq群955171419,加入微信群請掃碼:總結
以上是生活随笔為你收集整理的【Python】pandas 缺失数据处理大全(附代码)的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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