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编程问答

tcga数据下载_好东西丨零基础入门TCGA

發布時間:2024/10/8 编程问答 31 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 tcga数据下载_好东西丨零基础入门TCGA 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

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課程大綱:

TCGA簡介

1、帶你熟悉新版TCGA界面

2、TCGA包含哪些數據,哪些是公開可用的?作為新手,下載什么水平的數據最易上手

3、TCGA文件ID介紹,讓你不在懵圈

實例演示TCGA數據下載、整合

1、單個癌癥特定類型數據下載(基因表達數據),可直接下載或借助下載工具GDC Data Transfer Tool

2、R處理數據的基本操作——數據整合、ID對應

TCGA簡單應用——某種癌癥的差異基因篩選

1、應用R進行差異表達基因篩選流程

2、使用R軟件包進行差異表達基因統計分析、火山圖和聚類圖制作

附錄:

課件、代碼及數據下載:TCGA入門

鏈接: https://pan.baidu.com/s/1WYIUGmWA5kdxVhk2BEqISA 密碼: ysi9

總結

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