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编程问答

Pytorch实现U-net视网膜血管分割

發布時間:2024/9/30 编程问答 61 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 Pytorch实现U-net视网膜血管分割 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

網絡結構


U-net是MICCAI2015的專門針對醫學影像分割設計的網絡結構,直到今天還是很好用,效果任然很好。網絡的左半部分是Encode
部分,此部分將輸入圖像逐步下采樣得到高層的語義信息。右半部分是Decoder部分,將Encode提取的語義特征逐步恢復為原始圖像的尺寸,中間是跳躍連接,將下采樣過程中提取到的不同level的特征加入到Decoder中,得到更好的分割結果。

完整訓練代碼和數據可以去我的github上面下載:https://github.com/SPECTRELWF/Semantic-Segmentation
個人主頁:liuweifeng.top:8090

數據集介紹



數據集是來自網上的視網膜血管分割數據集,訓練集只有二十張圖像,少得可憐。測試集也是二十張圖像。原始數據集中image和label使用.tif和.gif格式存儲的,需要先進行一下預處理,將數據組織成想要的樣子,再來進行訓練。

train

# !/usr/bin/python3 # -*- coding:utf-8 -*- # Author:WeiFeng Liu # @Time: 2021/12/9 下午1:54from unet_model.unet import UNET from dataset import SWXG_Dataset import torch.optim as optim import torch.nn as nn import torchdef train_net(net,device,data_path,epochs=40,batch_size=1,lr=1e-5):isbi_dataset = SWXG_Dataset(data_path)train_loader = torch.utils.data.DataLoader(isbi_dataset,batch_size,shuffle = True)#使用RMSprop優化optimizer = optim.RMSprop(net.parameters(),lr,weight_decay=1e-8,momentum=0.9)criterion = nn.BCEWithLogitsLoss()best_loss = float("inf")for epoch in range(epochs):net.train()for images, labels in train_loader:optimizer.zero_grad()images = images.to(device,dtype = torch.float32)labels = labels.to(device,dtype=torch.float32)pred = net(images)loss = criterion(pred,labels)print('epoch:%d train loss:%f' % (epoch+1,loss.item()))if loss <best_loss:best_loss = losstorch.save(net.state_dict(), 'best_model.pth')loss.backward()optimizer.step()if __name__ == "__main__":device = torch.device('cuda:0')net = UNET(n_channels=1,n_classes=1)net.to(device)data_path = r'Dataset/train/'train_net(net,device,data_path)

結果:


訓練30個epoch之后的結果看起來還是很好的。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的Pytorch实现U-net视网膜血管分割的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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