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编程问答

Pandas直接读取arff格式的文件,这种需求还是头一次碰到!

發(fā)布時間:2024/9/15 编程问答 36 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 Pandas直接读取arff格式的文件,这种需求还是头一次碰到! 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.

作者/小小明

來源/快學(xué)Python

常規(guī)arff文件讀取

之前有位群友遇到了arff格式的數(shù)據(jù),卻不知道怎么讀取:

然后我讓這位群友把文件發(fā)我,給我分析一下,我用文件編輯器打開后,發(fā)現(xiàn)格式如下:

只是一個文本文本而已,解析文本文件我實在太擅長了。可以看到:

  • 編碼是utf-8

  • 列名都在以@attribute開頭的行

  • 數(shù)據(jù)在@data的后面的部分 理解了這三點,我馬上就能用pandas直接讀取它,下面看看代碼:

import?pandas?as?pdwith?open("adult_census_19210979.arff",?encoding="utf-8")?as?f:header?=?[]for?line?in?f:if?line.startswith("@attribute"):header.append(line.split()[1])elif?line.startswith("@data"):breakdf?=?pd.read_csv(f,?header=None)df.columns?=?header df

結(jié)果如下:

為了后續(xù)使用方便,我們可以將上面的代碼封裝成函數(shù):def?read_arrf(file):with?open(file,?encoding="utf-8")?as?f:header?=?[]for?line?in?f:if?line.startswith("@attribute"):header.append(line.split()[1])elif?line.startswith("@data"):breakdf?=?pd.read_csv(f,?header=None)df.columns?=?headerreturn?df

這樣,讀取任何arrf文件都方便,只需要直接傳入即可:

read_arrf("adult_census_19210979.arff")

然后我得到了:

不過其實scipy已經(jīng)含有讀取這種常規(guī)的arff文件的方法:import?pandas?as?pd from?scipy.io?import?arffdata,?_?=?arff.loadarff("adult_census_19210979.arff") df?=?pd.DataFrame(data) df

結(jié)果如下:

不一樣的地方主要在于字符串都會讀成字節(jié)的形式。

稀疏矩陣形式的arff文件讀取

這只是開胃小菜,昨天有位即將從電子科技大學(xué)畢業(yè)的網(wǎng)友聯(lián)系到我,說arff文件不僅僅只有上面的存儲形式,還有以稀疏矩陣的格式存儲的。

數(shù)據(jù)文件來源:http://sites.labic.icmc.usp.br/text_collections/?C=D;O=A

例如:

以稀疏矩陣形式存儲時,存儲格式是指定位置存對應(yīng)的值(空格分割)。

最終完整的讀取代碼為:

import?pandas?as?pddef?read_sparse_arrf(file):with?open(file,?encoding="utf-8")?as?f:header?=?[]default_field?=?{}field_num?=?0for?line?in?f:if?line.startswith("@attribute")?or?line.startswith("@ATTRIBUTE"):_,?name,?field_type?=?line.split()header.append(name)if?field_type.startswith("{"):default_field[field_num]?=?field_type[1:-1].split(",")[0]field_num?+=?1elif?line.startswith("@data")?or?line.startswith("@DATA"):breakdefault_field_keys?=?set(default_field.keys())width?=?len(header)data?=?[]for?line?in?f:line?=?line.strip()if?not?line:continuetmp?=?[0]*widthflags?=?set()for?kv?in?line[1:-1].split(","):k,?v?=?kv.split()k?=?int(k)if?k?not?in?default_field_keys:v?=?int(v)flags.add(k)tmp[k]?=?vfor?k?in?default_field_keys-flags:tmp[k]?=?default_field[k]data.append(tmp)return?pd.DataFrame(data,?columns=header)

測試讀取:

df?=?read_sparse_arrf("CSTR_sparse.arff") df

結(jié)果如下:

df?=?read_sparse_arrf("CSTR_sparse.arff") df

結(jié)果如下:

df?=?read_sparse_arrf("oh15.arff") df

結(jié)果如下:

注意:上面代碼假設(shè)了稀疏矩陣形式的arrf文件,非{}可選形式,均為數(shù)值類型。

最終這位朋友對結(jié)果還挺滿意的:我感覺要感謝這個朋友指出我沒有碰到過的這種arrf格式。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的Pandas直接读取arff格式的文件,这种需求还是头一次碰到!的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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