為了支持公共使用和散布基因表達數據，NCBI開始了基因表達匯編(GEO)計劃。GEO是努力建立一個基因表達數據倉庫和在線資源，用于從任何物種或人造的來源檢索基因表達數據。來自microarray，高密度寡核苷酸array(HAD)，雜交膜(filter)和SAGE的許多類型的基因表達數據都被接受，登記，和存檔，作為一個公共數據集合。一系列預先計算的數據的定義和描述，以及用于交互檢索和分析這些表達數據的在線工具即將放入。

一個GEO倉庫概念圖解的頂層視圖顯示四個基本實體：提交者，平臺，系列和樣本。

提交者：提交者的聯系和登錄信息。

同許多平臺，許多樣本和許多系列有關系。

平臺：關于用于以高通量方式檢查樣本的物理試劑的信息。

同一個提交者，許多樣本有關。

樣本：關于被檢查的mRNA樣本，實驗條件，和實驗產生的基因表達測量數據信息。

同一個提交者，一個平臺和許多系列有關。

系列：樣本收集，樣本是如何相關的，如何排序的，分析是如何進行的，和聚類數據是如何獲得的信息。

同一個提交者，許多樣本有關。

FAQ:

我如何提交我的數據？

為了提交數據，你需要同我們建立你的身份，用登錄用戶和密碼。第一次你登錄時，我們將問你聯系方式，這些將在別的用戶使用你的數據是被檢索出來。這些信息僅需要填寫一次。你只有在提交數據的時候才登錄，檢索數據不用登錄。在試圖提交數據以前，請仔細閱讀GEO提交指南。

GEO是否提供“一定日期前保留”服務？

是的。這個特點允許一個提交者提交數據給GEO，并且在數據公布前得到一個GEO登記號。

GEO將接受什么樣的數據？

GEO設計成圍繞目前常用的大多數高通量和并行基因表達測量技術的特點。這些技術是雜交膜，microarray，高密度寡核苷酸array，和SAGE。但是，事實上，任何的數據只要達到提交的要求都會被接受。GEO實體的分條描述和它們的數據字段給出了更多的信息。

GEO是否存檔未加工的數據圖？

不。然而，一個參考圖將被可選的接受(以JEPG形式，低于一定的大小)。同x，y坐標可選的參考一起，這個圖可以提供給數據的查詢者一個對數據定性的評估。

有沒有任何GEO 要求的QA(質檢)測量？

目前沒有。這個要求將在將來被加入。

我如何加入QA測量到GEO中去？

QA測量目前是可選的。如果在圖像分析階段進行了QA測量，這些可以被存儲在另外的樣本數據表欄中。

我如何提交重復實驗到GEO？

你必須提交樣本數據，然后用提交一系列類型為“重復樣本組”關聯這些樣本。這個在這些樣本之間的關聯將顯示什么時候任一樣本被一個查詢檢索了。Microarray上同一點的重復測量可以在樣本數據表的增加欄里出現。

我如何能過提交更正？

如果數據重提交或更正時必須的，請同geo@ncbi.nlm.nih.gov聯系。

馬上要有的……對一個已經存在的和有效的GEO登錄號的數據的重提交(要有恰當的提交者的認證)將引起那些數據元素新的版本被創立。所有各種數據元素的版本都將永遠保留被檢索。

總結

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