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编程问答

【Pytorch】AWSnet论文解读与实验复现

發布時間:2024/3/12 编程问答 43 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 【Pytorch】AWSnet论文解读与实验复现 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

論文算法概括

文獻題目:《AWSnet: An auto-weighted supervision attention network for myocardial scar and edema segmentation in multi-sequence cardiac magnetic resonance images》
開源項目鏈接:https://github.com/soleilssss/AWSnet/tree/master

Abstract

該文章的目的是從多序列(Multi-sequence)CMR圖像中分割心肌瘢痕和水腫,采用自動權重監督框架(auto-weighted supervision framework,ASF)。并使用強化學習實現不同監督層間的交互。此外,作者利用形狀先驗知識對小心肌病理區域進行ROI分割,并進一步采用兩個分割粒度不同的模型進行操作。粗粒度分割模型分別將左心室心肌結構識別為形狀優先,而細粒度分割模型將像素級注意力機制與ASF模型相結合,從數據中學習和提取顯著的病理特征。采用多序列CMR(MyoPS 2020)的心肌病理學分割公開數據集進行測試實驗。

前序儲備知識

bSSFP CMR

  • 在磁共振序列中,當縱向磁化矢量橫向磁化矢量均達到穩態,這種情況我們稱之為穩態自由進動(Steady State Free Precession, SSFP);
  • 當設置合理的TR、TE及翻轉角,使得多個射頻脈沖產生的各種回波(FID、SE及STE)都剛好融合成一個回波,達到一個平衡狀態,這種梯度回波序列稱為平衡式穩態自由進動序列(balance SSFP, bSSFP)。
  • 算法模塊

    CASN(Cascaded Anatomical Segmentation Network)(級聯解剖分割網絡)

    該級聯分割網絡用于勾畫左心室外膜的輪廓,包括兩個不同粒度的網絡,其中第一個粗粒度分割網絡感知的區域大致地包含了左心室區域,在此基礎上裁剪出感興趣區域(ROI),第二個細粒度網絡將更精準地分割出左心室區域。

    ASAN(Auto-weighted Supervision Attention Network)

    • ASAN1
      Early fusion to identify three categories-background, scar and ring-shaped myocardium(環狀心肌).
    • ASAN2
      Extract myocardial pathology(including scar and edema) from ring-shaped myocardium and background.

    DAS(Deep Auto-weighted Supervision)

    對于訓練數據規模有限的小器官圖像分割問題,梯度消失(爆炸)問題會很大程度上影響訓練過程。Deep supervision(深監督)通過在神經網絡中間隱藏層中加入輔助分類器,作為分支的輔助分類器用于判斷隱藏層特征圖的質量,進而起到對主干網絡的監督作用,以此優化訓練的過程。
    深監督的表現主要取決于監督損失平衡權重的分布,在不同任務和場景下具有較大差異。 考慮到這一點,作者提出使用強化學習(RL) 框架以動態優化監督損失的平衡權重。

    PAM(Pixel-wise Attention Module)

    復現實驗流程

    搭建實驗環境

    本實驗基于anaconda,根據開源項目的提示安裝實驗所需的依賴。

    訓練網絡

    模型檢驗

    總結

    以上是生活随笔為你收集整理的【Pytorch】AWSnet论文解读与实验复现的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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