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關于hdf5文件

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HDF（Hierarchical Data Format）指一種為存儲和處理大容量科學數據設計的文件格式及相應庫文件。詳見其官方介紹：https://support.hdfgroup.org/HDF5/ 。

Python 中有一系列的工具可以操作和使用 HDF5 數據，這里只介紹 h5py。
一個 HDF5 文件是存儲兩類對象的容器，這兩類對象分別為：
dataset：類似數組的數據集合；
gropp；類似目錄的容器，其中可以包含一個或多個 dataset 及其它的 group。
參考鏈接：https://www.jianshu.com/p/de9f33cdfba0

h5文件的讀取

這里以我要用的模型的h5文件為例，是AudioSet數據集的一部分，論文的作者是將tfrecord格式寫成了hdf5格式，因此想要讀取這樣格式的文件來看看里面的內容。

# python 2 #coding=utf-8 import datetime import os import h5py import numpy as np# f = h5py.File('path/filename.h5','r') #打開h5文件 f = h5py.File('E:/2018/AudioSet/bal_train.h5','r') f.keys() #可以查看所有的主鍵 print([key for key in f.keys()])

運行程序后，結果有：

可以看到主鍵有3部分，分別為：
video_id_list, x, y

因此可以繼續查看主鍵里面的內容，這部分直接用print語句就能實現，接在主鍵程序之后，這里簡單舉例說明一下：

print('first, we get values of x:', f['x'][:]) print('then, we get values of y:', f['y'][:]) print(f['x'][:].shape) print(f['y'][:].shape)

運行這一部分的代碼，結果有：

可以看到，通過print語句，得到了三個主鍵里面內容的大小，就我的h5文件，里面的video_id_list是一個存放了歌曲id的列表文件, x是輸入的歌曲的特征文件22160是樣本數目，（10,128）代表了樣本是一個10×128的矩陣, y是一個標簽文件，（22160，527）代表大小是22160×527，其中527是類別的數目。

可以利用io.save()函數來保存主鍵中的內容，。

from scipy import io io.savemat('x.mat', {'data': f['x'][:]}) io.savemat('y.mat', {'data': f['y'][:]}) io.savemat('video_id_list.mat', {'data': f['video_id_list'][:]})

最后，給出完整的代碼：

# python 2 #coding=utf-8 from scipy import io import os import h5py import numpy as np#打開h5文件 f = h5py.File('path/filename.h5','r') #查看文件 f.keys() #可以查看所有的主鍵print([key for key in f.keys()]) print('first, we get values of x:', f['x'][:]) print('then, we get values of y:', f['y'][:]) print(f['x'][:].shape) print(f['y'][:].shape)#保存數據 io.savemat('x.mat', {'data': f['x'][:]}) io.savemat('y.mat', {'data': f['y'][:]}) io.savemat('video_id_list.mat', {'data': f['video_id_list'][:]})

總結

以上是生活随笔為你收集整理的.h5文件的读取的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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