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编程问答

Offline spike sorter 神经元脉冲单位分类软件

發(fā)布時間:2023/12/20 编程问答 29 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 Offline spike sorter 神经元脉冲单位分类软件 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.

自行研制了Offline spike sorter 神經元脈沖電位分類軟件。
技術原理:
首先對原始波形進行高通濾波,去除場電位;接著根據(jù)spike形態(tài)特征,提取出spike 波形。對spike波形進行PCA投影降維,根據(jù)主成分特征,利用聚類算法進行聚類,得到spike分類結果,并得到每類的信噪比和噪聲標準差。

使用手冊 \n
第一步:選擇文件名(支持mat,rhs格式),注意可以選擇多個文件進行分析,選擇通道,點擊顯示波形;如果spike為正,可按反轉波形按鈕。\n
第二步:顯示波形的局部s并可以保存該部分數(shù)據(jù)為mat格式。如果需要看全部波形,開始時間數(shù)值設為0,結束時間設為比波形時間長的任意數(shù)值\n
第三步:250hz高通濾波,采用butter濾波,同時去除了較多工頻干擾;或者采用輕微濾波,除了較少工頻干擾\n
第四步:設置提取spike參數(shù),如spike最小值的上下限uV,長度ms,振幅uV,間隔ms,然后提取spike;最重要的參數(shù)是閾值上限,其他可以采用默認值;\n
注意提取spike后一定要按預處理按鈕!后面如果僅改變類別數(shù),就不再需要按預處理按鈕,直接按聚類按鈕\n
第五步:確定spike類別數(shù)量,在『保留類別』框設置顯示不同類別,1表示顯示該類,0表示不顯示,如101意思是只顯示第1和第3類,按聚類按鈕進行聚類,得到信噪比snr。保留類別參數(shù)修改后可按去雜點按鈕顯示;\n
第六步:設置雜點去除比例%,按去雜點按鈕顯示;\n
其他功能:\n
1、spike數(shù)量,可以得到任意時段的每類spike數(shù)量和峰值均值。\n
2、顯示場電位:顯示局部波形的場電位。保存場單位:保存局部波形的場電位。\n
3、ALL DONE 按鈕可以一鍵操作,比如只是改變了通道數(shù),其他參數(shù)不需改變,則ALL DONE按鈕可以得到所有結果(采用濾波按鈕)。\n
4、如果打開多個文件,還可以進行傳感器時間漂移分析,顯示不同文件對應的PC和相似度。\n
5、通道掃描功能可以快速給出哪些通道是否有spike存在。如 (channel:nspike) 幾乎存在spike的通道為:[(20, 74), (24, 79)]
可能存在spike的通道為:[(5, 73), (8, 99), (9, 52), (10, 49), (11, 48), (15, 88), (21, 52), (22, 56), (23, 127), (25, 80), (26, 59), (27, 147)]\n
6、保存圖片可以在每個圖片框按右鍵彈出菜單Export操作,在plot options中可進行fft變換。

傳感器時間漂移性能分析

總結

以上是生活随笔為你收集整理的Offline spike sorter 神经元脉冲单位分类软件的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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