interproscan 软件对序列进行GO 注释
生活随笔
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interproscan 软件对序列进行GO 注释
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
interproscan 軟件實(shí)際上將對(duì)輸入的查詢序列和interpro 數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列去比對(duì),將比對(duì)上的序列對(duì)應(yīng)的GO信息作為查詢序列的GO注釋
在interpro 數(shù)據(jù)庫(kù)中,每條蛋白質(zhì)序列有一個(gè)唯一的interpro 編號(hào),類似 IPR034725 這種格式,而每條蛋白又有對(duì)應(yīng)的GO注釋信息;
可以通過(guò)下面的鏈接得到 IPR 編號(hào)和GO 注釋信息之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/interpro2go
這個(gè)鏈接中的內(nèi)容如下:
總結(jié)
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