pymatgen讀/寫各種文件

pymatgen是材料大數據計算的必備程序包了，其也作為API與materials project對接，可以批量下載自己想要的材料結構、性質，它也提供了大量VASP計算后的數據處理、計算，堪稱材料基因組學的神器！

pymatgen提供了讀取CIF、json、POSCAR、CONTCAR等文件的程序，可以批量讀取、轉化、另存。不過，作為初學者，里面很多功能是很難理解的，特別是對python語言不熟的同學。

1. pymatgen讀取json文件，轉化為Structure對象，并保存為CIF文件

from pymatgen import Structure, Lattice, MPRester, Molecule

import json

from pymatgen.io.cif import CifWriter

# 如果只有一個結構

#data_file = open("../db-1.json", "r")

#all_structures = data_file.readlines()

#structure = json.loads(all_structure)["structure"]

structure = Structure.from_dict(structure)

c = CifWriter(structure)

c.write_file("1.cif")

# 如果是一個結構數據庫，讀取后保存為cif文件

data_file = open("db.json", "r")

all_structures = data_file.readlines()

i = 0

for structure in all_structures:

structure = json.loads(structure)["structure"]

structure = Structure.from_dict(structure)

i = i + 1

c = CifWriter(structure)

c.

總結

以上是生活随笔為你收集整理的python库读取cif文件_Pymatgen读/写各种文件,pymatgen,读写的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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