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mysql客户端查询_MySQL数据库之利用mysql客户端查询UCSC数据库

發布時間:2023/12/10 数据库 27 豆豆
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本文主要向大家介紹了MySQL數據庫之利用mysql客戶端查詢UCSC數據庫 ,通過具體的內容向大家展現,希望對大家學習MySQL數據庫有所幫助。

UCSC?Genome?Browser是由University?of?California?Santa?Cruz?(UCSC)?創立和維護的,該站點包含有人類、小鼠和大鼠等多個物種的基因組草圖和注釋信息,并提供一系列的網頁分析工具。

1.MySQL安裝

本人使用的是Centos6.8系統,推薦使用yum安裝。

$?yum?install?-y?mysql?mysql-devel?mysql-server

2.MySQLdb安裝

MySQLdb是MySQL的一個線程兼容接口,提供了python數據庫API,推薦yum安裝。

$?yum?install?-y?MySQL-python

3.使用腳本geneInfo.py獲得基因(注,為geneSymbol名)的bed信息

$?python?geneInfo.py?brca1

【參考列表】

UCSC數據庫

UCSC數據庫表結構

本文由職坐標整理并發布,希望對同學們學習MySQL有所幫助,更多內容請關注職坐標數據庫MySQL數據庫頻道!

總結

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