【实用案例】R语言gdm函数实现地理探测器分析
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
【实用案例】R语言gdm函数实现地理探测器分析
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
R語言實現地理探測器分析
- 碎碎念
- 查看官網例子
- 代碼
碎碎念
最近由于學習需要,接觸了地理探測器。地理探測器有Excel版和R語言版,起初我是用Excel試著做,地理探測器分析都需要先將數據離散化,而不同的離散化方法又會產生不同的分析結果,到底哪個才最優不得而知,一個個去調試也太麻煩了,而且Excel版不適合數據量大的情況下分析,會出現卡頓、閃退的情況(也許是我的電腦太垃圾),所以我就摸索了一下R語言實現地理探測器分析的方法。
查看官網例子
地理探測器有4個部分:factor detector、interaction detector、risk detector、ecological detector,官網上有對這四個探測器分別用代碼實現的語句,這里不做介紹。
GD包還提供了一個一步到位的函數gdm,實現數據最優離散化選擇方案,不用自己一個調試了。
輸入上述語句就彈出gdm的使用方法頁面,有兩種:(其實官方給的代碼已經非常詳細、好懂了)
根據提供的具體案例進行嘗試,發現案例中使用的數據集,有一列這樣類型的值。
在我自己后續的嘗試中,發現如果不添加這一種類型的數據,就會報錯:
> aging <- gdm(Y ~ ., continuous_variable = continuous_variable, data = data4, discmethod = discmethod, discitv = discitv) Error in if (qv12 < min(qv1, qv2)) { : 需要TRUE/FALSE值的地方不可以用缺少值所以我也加了一列類似的數據,后面就成功了。要根據自己數據的實際情況哦。我的是統計年鑒數據,所以我添加的那一列就是各省的分區,用字母表示。順便將代碼分享給大家
代碼
#安裝“GD”包 #Load GD package install.packages("GD") library(GD) #讀取文件 testdata <- read.csv("E:/geodetector/data.csv", header = TRUE, sep = ",") #GD包里有提供五種監督離散化方法,這行代碼對空間數據進行離散化處理 discmethod <- c("equal","natural","quantile","geometric","sd") #空間數據離散化分成3~7類,當然可以自己根據實際情況修改 discitv <- c(3:7) #定義連續變量 #因為我的testdata都是統計年鑒上的數據,所以都都需要進行空間數據離散化處理 continuous_variable <- colnames(testdata)[-c(1,17)] #調用gdm函數 testgdm <- gdm(Y ~ ., continuous_variable = continuous_variable, data = testdata, discmethod = discmethod, discitv = discitv) #顯示分析結果 testgdm #顯示分析圖表 plot(testgdm)拜拜!
總結
以上是生活随笔為你收集整理的【实用案例】R语言gdm函数实现地理探测器分析的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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