Ubuntu系统安装及Gamit 的安装流程
Ubuntu系統(tǒng)安裝及Gamit 的安裝流程
此文編寫內(nèi)容主要來自科學(xué)網(wǎng)——摯友陳超博客，感謝我的好友陳超。
http://blog.sciencenet.cn/blog-858128-788101.html
運行Gamit 是基于linux系統(tǒng)運行的，可以在Sun，Solaris，HP，redhat 、ubuntu等類型上運行，ubuntu系統(tǒng)可以直接在windows系統(tǒng)上安裝，即雙系統(tǒng)，也可以借助VMware安裝。
目前已經(jīng)出了Gamit 10.7版本了。
Gamit 10.5軟件文件
主要安裝過程
主要安裝最好是在root身份下安裝
gamit 需要的運行環(huán)境配置
gfortran , gcc , libx11, csh, tcsh配置
在終端中輸入:sudo -s,然后按提示輸入密碼安裝配置環(huán)境：
sudo -s apt-get install gcc apt-get install gfortran apt-get install csh apt-get install tcsh apt-get install libx11-dev上述配置環(huán)境請耐心等待安裝，要連接網(wǎng)絡(luò)。
配置shell
輸入
echo $SHELL看下當(dāng)前是什么類型的shell，一般情況下,ubuntu 默認(rèn)的都是bash,雖然gamit是用csh寫的，但是經(jīng)過測試，即可以在csh中安裝，也可以在bash中安裝。
若想在csh中安裝，則需要改變當(dāng)前的shell，在終端輸入
chsh按提示輸入密碼（如果是在root身份就不需要密碼）。然后輸入shell的路徑，以下操作是從bash改變?yōu)閏sh，因此輸入路徑為:
/bin/csh但是上面步驟完成以后，我們輸入
echo $SHELL再查看一下，發(fā)現(xiàn)shell仍然是bash，注意了，這里是改變登錄時的默認(rèn)shell，因此若想讓以上改變生效，只需要注銷下，重新登錄下就可以啦。
bash臨時改變?yōu)閏sh
臨時改變shell的簡單方法，若是由bash改變?yōu)閏sh，只需要在終端輸入csh即可，同理變回來只需輸入bash。臨時的改變shell只對當(dāng)前的終端是有效的，但這對于gamit的安裝已經(jīng)足夠了。
gamit軟件的準(zhǔn)備及安裝
一般情況下都是需要先將gamit的源代碼復(fù)制到/opt目錄下，假設(shè)你的gamit源代碼文件夾為gamit10.4，并且位于桌面上，那么只需要在終端輸入:mv ~/桌面/gamit10.4 /opt ，即可將其移動到opt下，然后進入opt，輸入 cd/opt/gamit10.4，繼續(xù)輸入ls -al，查看下gamit10.5文件夾下都有什么文件。找到一個叫install_software的文件，查看其權(quán)限，若沒有可執(zhí)行權(quán)限，則給他加上就可以了（chmod +x install_software）。
chmod +x install_software然后在終端輸入
./install_software，則開始gamit的安裝了。
第一個直接輸入Y就可以了，然后它會問你x11的目錄是否正確，那么你需要找到gamit的配置文件并修改下，具體方法如下：按ctl+alt+t新開一個終端，進入到opt中的gamit10.4文件夾下，
cd libraries進入libraries文件夾中，
sudo gedit Makefile.config然后就會彈出一個該文件的編輯框，我們需要修改的地方主要有三個，第一個是x11的路徑，將其修改成gamit自動搜索到的x11路徑，如我的系統(tǒng)中是如下圖所示：這個common下的配置是按照不同的操作系統(tǒng)來配置的，每三行一組，我們的ubuntu是在一般操作系統(tǒng)中(Generic)；
主要修改的就是x11LIBPATH和X11NCPATH。千萬記得保存一下哦。
第二個需要修改的地方就是gamit的內(nèi)部參數(shù)了，實際上就是寫代碼時聲明的常量。分別是MAXSIT(最大測站數(shù))、MAXSAT(最大衛(wèi)星顆數(shù))、MAXATM(最大的天頂延遲)、MAXEPC（最大歷元數(shù)）;
在這里，我們只需要將MAXATM改為25即可（默認(rèn)為13）。
其實，在這里不改也是可以的，以后我們用到的時候再改也不遲，這些常量的定義分別位于/gamit/include/dimpar.h 、makex.h頭文件中。第三個需要修改的地方就是操作系統(tǒng)的版本號啦，再往下拉，就可以看到OS dependent blocks字樣。這里也是按操作系統(tǒng)來分類的撒，可惜我們的ubuntu在最后幾個哦，所以再往下拉，找到for linux from 0.0.1 to 3.0.0字樣，然后我們修改下面的一行，OS_IDLinux 0001 3202，記住只修改最后的那四個數(shù)字為3001就好了。保存一下，關(guān)掉。再返回安裝linux的那個終端中，按Y繼續(xù)安裝就可以啦，到最后顯示gblock installed(當(dāng)然過程還是比較漫長的，尤其是fortran編譯器在編譯時，給人的感覺像死機了一樣，連鼠標(biāo)都動不了)。然后它問是否創(chuàng)建gg的鏈接文件（就是快捷方式），直接按Y就可以啦。
配置gamit的命令路徑
到上面幾步完成以后，會自動顯示怎么配置路徑的哦。如果路徑配置不好，上面的都是白做了。
路徑的配置也是分為兩塊（bash和csh），如果是用csh安裝gamit的，則配置路徑如下：需要在主文件夾下新建一個空白文檔，并重命名為.cshrc。注意這是一個隱藏文件，因此在這之前，應(yīng)該按ctrl +H ,顯示所有的隱藏文件。然后雙擊打開那個新建的.cshrc文件，復(fù)制一下內(nèi)容到該文件中：
千萬注意了，你自己在復(fù)制的時候一定要將
改成你自己的gamit安裝位置哦。然后保存下。
回到終端(進入主目錄下面)，輸入source ~/.cshrc，對該配置文件進行下加載。那么這個路徑就生效了。 若想驗證下有沒有配置成功，只需要在終端下輸入 echo $PATH，看看path中有沒有g(shù)amit的路徑，若有的話就成功了。
然后新開一個終端，檢驗下gamit是否安裝成功，輸入命令
sh_get_rinex若顯示command not foud，則安裝失敗，顯示一大堆的幫助信息，則成功了。
也可以輸入doy測試是否安裝成果。
以上為csh的路徑配置，下面介紹下bash的路徑配置，若有朋友是用默認(rèn)的bash安裝gamit 的，則只需要在終端輸入
sudo gedit ~/.bashrc彈出一個文件編輯框，只需要在文件的最后添加以下代碼即可（千萬注意將gamit10.4改成你自己的安裝目錄哦）：
export PATH="$PATH:/opt/gamit10.4/gamit/bin:opt/gamit10.4/com:/opt/gamit10.4/kf/bin" export HELP_DIR=/opt/gamit10.4/help/保存退出就可以啦，檢驗是否安裝成功的方法同上。好了，開始體驗gamit的神奇吧！
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的Ubuntu系统安装及Gamit 的安装流程的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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