易生信系列課程 轉(zhuǎn)錄組，ChIP-seq，擴(kuò)增子和宏基因組是從原始數(shù)據(jù)到分析結(jié)果的理論加實(shí)戰(zhàn)型課程，課程安排內(nèi)容飽滿(mǎn)，時(shí)間緊張，是學(xué)習(xí)專(zhuān)業(yè)生信分析和解決實(shí)際問(wèn)題的首選課程。這些課程適合零基礎(chǔ)或者有一定分析經(jīng)驗(yàn)的朋友學(xué)習(xí)，但都需要后續(xù)加強(qiáng)練習(xí)，基礎(chǔ)越好，學(xué)的效果越好。不管什么課程，只想著靠3天就能學(xué)會(huì)，是不現(xiàn)實(shí)的 (基礎(chǔ)好除外)。我們是希望通過(guò)3天時(shí)間，把整個(gè)分析過(guò)程和我們的分析經(jīng)驗(yàn)糅合在一起，帶領(lǐng)大家走一遍，節(jié)省需要自己摸索半年甚至多年的時(shí)間，后續(xù)再輔以視頻和我們提供的全套流程腳本練習(xí)，1-2個(gè)月掌握問(wèn)題不大。

作為對(duì)系列課程的補(bǔ)充，我們這次推出生物信息通識(shí)課，包含常見(jiàn)組學(xué)技術(shù)的原理、應(yīng)用和概念，R語(yǔ)言基礎(chǔ)，Windows下使用Linux命令快速提取數(shù)據(jù)和準(zhǔn)備繪圖所需的文件，常見(jiàn)組學(xué)圖形的解讀和繪制等，希望能為實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家了解生信和生信初學(xué)者提供一個(gè)快速通道。

課程涉及主要內(nèi)容如下：

每節(jié)課1小時(shí)一個(gè)主題，理論結(jié)合實(shí)戰(zhàn)，學(xué)懂原理，實(shí)戰(zhàn)實(shí)操，全是老司機(jī)多年經(jīng)驗(yàn)和代碼的無(wú)私分享。下面是課程安排，如11代表第一天第一節(jié)課，26代表第二天第六節(jié)課，(實(shí)際上課會(huì)有調(diào)整，理論和實(shí)戰(zhàn)穿插調(diào)和)41為兩周后的線(xiàn)上集中視頻答疑。

編號(hào)主題簡(jiǎn)介

11	生物信息是什么	能解決哪些問(wèn)題，有哪些應(yīng)用
12	高通量技術(shù)概述	高通量測(cè)序應(yīng)用的種類(lèi)、概念、原理和用途介紹
13	不同代次高通量測(cè)序技術(shù)	原理和優(yōu)缺點(diǎn)
14	組學(xué)和生物調(diào)控	案例解析
15	擴(kuò)增子和宏基因組	基本概念和應(yīng)用
16	擴(kuò)增子和宏基因組	基本分析思路和圖表解讀
17	常見(jiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)使用介紹	多組學(xué)分析
21	繪制miRNA、基因、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，菌群共存	公共數(shù)據(jù)庫(kù)獲取數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換格式,文獻(xiàn)挖掘
22	KEGG/Reactome/GO通路圖表達(dá)屬性可視化	Cytoscape,模式和非模式生物
23	R語(yǔ)言基礎(chǔ)知識(shí)	數(shù)據(jù)讀取轉(zhuǎn)換
24	R語(yǔ)言繪制常見(jiàn)圖形	見(jiàn)圖
25	R語(yǔ)言繪制常見(jiàn)圖形	見(jiàn)圖
26	繪制常見(jiàn)圖形和排版	可自己提需求
27	分組、時(shí)間序列和數(shù)量性狀GSEA	原理、操作和結(jié)果解讀
31	Linux基礎(chǔ)操作	常用命令解析，windows下操作
32	Linux軟件安裝	服務(wù)器操作
33	Sed,awk操作	ID轉(zhuǎn)換、文件格式轉(zhuǎn)換
34	Linux命令練習(xí)	準(zhǔn)備常見(jiàn)繪圖所需文件
35	WGCNA基因共表達(dá)分析	表型關(guān)聯(lián)
36	考試、圓桌論壇	自評(píng)學(xué)習(xí)效果、知識(shí)點(diǎn)回顧
41	答疑-線(xiàn)上	答疑、考試內(nèi)容串講

生物信息基本知識(shí)和概念

生物信息是什么，能解決哪些問(wèn)題，有哪些應(yīng)用

高通量測(cè)序有哪些類(lèi)型和應(yīng)用，smRNA-seq，RNA-seq, GRO-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C，scRNA-seq, ChIA-PET, FAIRE-seq, Ribo-seq, ChIRP, CAGE-seq, Clip-seq等等很多為解決特定問(wèn)題而生的技術(shù)。

不同代次高通量測(cè)序技術(shù)的原理和優(yōu)缺點(diǎn)

從細(xì)胞和DNA結(jié)構(gòu)闡釋生信在解析生物分子調(diào)控中的應(yīng)用

其它您想了解的生信知識(shí) (可報(bào)名時(shí)提出，也可現(xiàn)場(chǎng)提出)

CNS多組學(xué)文章2篇解讀 (轉(zhuǎn)錄組、表觀修飾組和突變組)

CNS常見(jiàn)生物信息圖形含義解讀、適用范圍和在線(xiàn)繪制

擴(kuò)增子和宏基因組

擴(kuò)增子和宏基因組研究基本概念

擴(kuò)增子和宏基因組研究基本分析思路

擴(kuò)增子和宏基因組研究圖標(biāo)解讀

微生物物種和功能組成CNS文章套路解讀

常見(jiàn)分析和圖形繪制

利用常見(jiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘基因的功能、表達(dá)模式和互作蛋白

從在線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取細(xì)胞類(lèi)型特異高表達(dá)的基因

在線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘基因的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控信息和表觀修飾信息

Cytoscape繪制網(wǎng)絡(luò)圖

Cytoscape繪制KEGG/Reactome通路圖并進(jìn)行表達(dá)屬性可視化

Cytoscape繪制轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和蛋白蛋白互作網(wǎng)絡(luò)

Cytoscape進(jìn)行GO富集分析和可視化

Cytoscape進(jìn)行文獻(xiàn)挖掘，探索基因功能

GSEA本地軟件使用和結(jié)果解讀

其它軟件后續(xù)補(bǔ)充

在線(xiàn)繪圖工具介紹

文章發(fā)表圖的修改和排版

R語(yǔ)言數(shù)據(jù)處理和繪圖入門(mén)

多組學(xué)數(shù)據(jù)分析

在線(xiàn)基因組瀏覽器加載公共數(shù)據(jù)解析多組學(xué)數(shù)據(jù), 聯(lián)合發(fā)布的轉(zhuǎn)錄組、表觀修飾和三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)查找基因的調(diào)控關(guān)系.

生信Linux基礎(chǔ)

生信軟件安裝基本概念和操作

生信Linux基礎(chǔ)學(xué)習(xí)

在windows下如何利用簡(jiǎn)單命令轉(zhuǎn)換文件格式，提取序列，ID匹配，為常用軟件提供數(shù)據(jù)輸入格式等

生信分析軟件舉例和適用范圍介紹

當(dāng)然，以上列出的也只是一部分內(nèi)容，更多的還希望各位朋友踴躍提出，定制專(zhuān)屬課程。

(如果基礎(chǔ)薄弱，報(bào)名付款成功后，可免費(fèi)領(lǐng)取基礎(chǔ)程序課，做好準(zhǔn)備工作, 讓程序成為我們的得力工具而不是學(xué)習(xí)新知識(shí)的絆腳石。)

往期精彩回顧

主講教師

陳同，博士，2015畢業(yè)于中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所，生物信息專(zhuān)業(yè)博士，在Cell Stem Cell(IF=23.2，第一作者兼封面文章)，Nucleic Acids Research，Stem Cells and Development等高水平雜志以第一作者或主要作者發(fā)表文章，運(yùn)營(yíng)有數(shù)萬(wàn)人關(guān)注的《生信寶典》微信公眾號(hào)，給你不一樣的學(xué)習(xí)生信體驗(yàn)。

劉永鑫，博士。2008年畢業(yè)于東北農(nóng)大微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)。2014年中科院遺傳發(fā)育所獲生物信息學(xué)博士學(xué)位，2016年博士后出站留所工作，任宏基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室工程師，目前主要研究方向?yàn)楹昊蚪M學(xué)數(shù)據(jù)分析與可重復(fù)計(jì)算。發(fā)表論文10余篇，SCI收錄7篇。2017年7月創(chuàng)辦“宏基因組”公眾號(hào)，目前分享宏基因組、擴(kuò)增子原創(chuàng)文章185篇，關(guān)注人數(shù)2.3萬(wàn)人，累計(jì)閱讀近300萬(wàn)次。

助教團(tuán)隊(duì)

十余名中國(guó)科學(xué)院、清華、北大博士(含在讀)，輪值講師和助教，輔助學(xué)員學(xué)習(xí)和矯正培訓(xùn)過(guò)程中不足的點(diǎn)。

授課模式

本課程以講解流程和實(shí)際操作為主，采用獨(dú)創(chuàng)四段式教學(xué)，封裝好的代碼全部分享，隨處可用：

• 第一階段 3天集中授課；
• 第二階段 自行練習(xí)2周；
• 第三階段 在線(xiàn)直播答疑；
• 第四階段 培訓(xùn)視頻繼續(xù)學(xué)習(xí)；
• 實(shí)現(xiàn)教-練-答-用四個(gè)環(huán)節(jié)的統(tǒng)一協(xié)調(diào)。

培訓(xùn)時(shí)間

2018-12-14 到 2018-12-16 (線(xiàn)下講解實(shí)戰(zhàn))
每天早9點(diǎn)到晚6點(diǎn)，半封閉式教學(xué) (最后1小時(shí)為集中討論時(shí)間，最后一天會(huì)稍微提前一些，多留出時(shí)間討論，也方便老師乘車(chē)返回)
報(bào)到時(shí)間：提前一天或者當(dāng)天都可以

授課地點(diǎn)

北京市西城區(qū)鼓樓明德大廈 (北京市舊鼓樓大街47號(hào)院2號(hào)樓2010)。

課程價(jià)格

截止 2018-12-8 4199 元/人

名額有限，每次課程報(bào)名滿(mǎn)40人后自動(dòng)關(guān)閉報(bào)名通道

提供易漢博基因科技實(shí)習(xí)機(jī)會(huì)或工作機(jī)會(huì)

課程連報(bào)有優(yōu)惠，具體見(jiàn)報(bào)名網(wǎng)站

課程福利

座位按報(bào)名并繳費(fèi)或預(yù)付款成功順序從前到后龍擺尾式排序

贈(zèng)送程序基礎(chǔ)課和對(duì)應(yīng)課程往期視頻課一份 (http://bioinfo.ke.qq.com)

多人 (N，10>N>1) 組團(tuán)報(bào)名并同時(shí)繳費(fèi)，每人還可減免N-1百元 (最高500)

贈(zèng)送金士頓U盤(pán)一個(gè)（32G含培訓(xùn)數(shù)據(jù)和腳本）

附推薦語(yǔ)分享對(duì)應(yīng)的招生信息到朋友圈，截圖發(fā)到train@ehbio.com 可獲得200元生信寶典騰訊課堂課程優(yōu)惠券（可拆分供多個(gè)課程使用）

注意事項(xiàng) *

需自備筆記本電腦，推薦使用win10系統(tǒng)，4G以上內(nèi)存(推薦8G)。課程實(shí)踐根據(jù)需要會(huì)提供云計(jì)算平臺(tái)

培訓(xùn)班所有數(shù)據(jù)，文檔為內(nèi)部資料，僅供參閱，未經(jīng)允許不得翻印外傳登刊

上課期間禁止錄音，錄像

成功付款的學(xué)員，若臨時(shí)有緊急事情不能到來(lái)的，可申請(qǐng)延期，更換后續(xù)培訓(xùn)班；也可申請(qǐng)退款

若開(kāi)課2周 (含) 前申請(qǐng)退款可退還85%費(fèi)用；開(kāi)課3個(gè)工作日 (含) 前申請(qǐng)退款退還70%的費(fèi)用 (若已開(kāi)發(fā)票需承擔(dān)相應(yīng)手續(xù)費(fèi))

不可先延期再退款
更多課程的詳細(xì)介紹，請(qǐng)掃描下方二維碼。

復(fù)制以下鏈接
http://www.ehbio.com/Training/跳轉(zhuǎn)報(bào)名頁(yè)，成為實(shí)驗(yàn)中不可或缺的人，趕快報(bào)名吧！

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的生物信息通识课培训的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò)，歡迎將生活随笔推薦給好友。