“玉米轉(zhuǎn)座子插入型突變體”五折優(yōu)惠

一年一度的雙十一來啦！中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所重大平臺(tái)中心隆重推出“玉米轉(zhuǎn)座子插入型突變體”5折優(yōu)惠活動(dòng)！即日起至12月15日，凡訂購“玉米轉(zhuǎn)座子插入型突變體”，即享原價(jià)3000元/份，現(xiàn)價(jià)1500元/份的優(yōu)惠，欲購從速！

聯(lián)系方式：
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所 孫老師

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突變體介紹

突變體是植物功能基因組學(xué)研究的基礎(chǔ)材料，轉(zhuǎn)座子作為一類可移動(dòng)的DNA元件，在植物突變體庫的構(gòu)建中被廣泛應(yīng)用。近期，來自中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所、河南農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所的合作團(tuán)隊(duì)，利用W22株系中天然存在的活化Ac轉(zhuǎn)座酶在K17株系背景中激活Ds轉(zhuǎn)座子，并在后代中純化了遺傳穩(wěn)定的Ds插入型突變體庫。使用自主研發(fā)的TEA-seq技術(shù)，合作團(tuán)隊(duì)在全基因組范圍高效測(cè)序鑒定了突變體單株內(nèi)的Ds基因組插入位點(diǎn)信息。

該突變體庫具有如下特點(diǎn)：

K17/昌7-2優(yōu)勢(shì)自交系遺傳背景，具備優(yōu)良農(nóng)藝性狀

全基因組鑒定到70600個(gè)非重復(fù)的Ds插入位點(diǎn)

在15852個(gè)基因區(qū)含有插入突變，覆蓋了約36%的玉米基因

轉(zhuǎn)座子攜帶剪切識(shí)別序列和終止密碼子，可造成基因失活

不涉及轉(zhuǎn)基因過程，后續(xù)科研和育種研究可按常規(guī)自交系管理

結(jié)合BSA/BSR技術(shù)可高效正向定位關(guān)鍵調(diào)控基因

玉米Ds插入突變體庫的鑒定為玉米功能基因組學(xué)研究提供了重要的材料資源，相關(guān)突變體和突變信息可在MEILAM數(shù)據(jù)庫進(jìn)行查詢，詳情見：http://www.maizetepolymorphism.com/AcDs/?

應(yīng)用案例一：重要調(diào)控基因的生物學(xué)功能論證

玉米重要馴化相關(guān)基因Teosinte Branched 1（TB1）調(diào)控側(cè)枝發(fā)育。我們鑒定到了一個(gè)新的等位突變事件，突變體tb1上游411bp處發(fā)生Ds轉(zhuǎn)座子插入，qRT-PCR驗(yàn)證該基因表達(dá)量下降。突變體產(chǎn)生側(cè)枝發(fā)育增加和多穗表型。INCW3與細(xì)胞壁發(fā)育有關(guān)在籽粒中表達(dá)，我們鑒定到一個(gè)新的等位突變事件，突變體incw3的第二外顯子發(fā)生了Ds插入，造成基因結(jié)構(gòu)破壞。突變體產(chǎn)生種子皺縮表型。

應(yīng)用案例二：重要農(nóng)藝性狀調(diào)控基因的高效正向定位

我們發(fā)現(xiàn)一個(gè)突變體具有籽粒皺縮表型，且果穗上飽滿與皺縮種子的表型分離比例接近3：1。選擇兩類表型種子各20粒，發(fā)芽后取樣建立BSR/BSA混池文庫并進(jìn)行測(cè)序，定位到3號(hào)染色體存在顯著的關(guān)聯(lián)峰。該區(qū)域中唯一的Ds插入事件發(fā)生在一個(gè)AGAMOUS-like 2轉(zhuǎn)錄因子的基因編碼區(qū)域。該基因?yàn)橛∮浶揎椈虿⒃谧蚜Ｖ懈叨忍禺惐磉_(dá)。綜上證據(jù)，可考慮認(rèn)為AGL2是玉米籽粒發(fā)育過程中的一個(gè)新的調(diào)控基因，受DNA甲基化特異調(diào)控，其受表觀遺傳學(xué)修飾調(diào)控過程及下游轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)需要進(jìn)一步研究。

注：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所劉君、程溪柳、呂明杰、付俊杰、劉遠(yuǎn)航、劉小溪等負(fù)責(zé)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、儀器設(shè)計(jì)、鑒定工具和在線數(shù)據(jù)庫開發(fā)、生化實(shí)驗(yàn)流程開發(fā)、生物信息學(xué)分析，河南農(nóng)業(yè)大學(xué)陳彥惠、庫麗霞、柳華峰等負(fù)責(zé)玉米突變體庫構(gòu)建、株系純化、K17基因組組裝，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所王歡、Joram Kiriga Waititu、孫瑩等負(fù)責(zé)儀器設(shè)計(jì)、生物信息學(xué)分析和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。相關(guān)工作得到科技部十三五重點(diǎn)研發(fā)，國(guó)家自然科學(xué)基金，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程等資助。

參考文獻(xiàn)

1.論文：Mingjie Lyu，Huafeng Liu，Joram Kiriga Waititu，Ying Sun， Huan Wang， Junjie Fu， Yanhui Chen，Jun Liu， Lixia Ku，Xiliu Cheng, TEAseq-based identification of 35,696 Dissociation insertional mutations facilitates functional genomic studies in maize, Journal of Genetics and Genomics, 2021, S1673-8527 (21) 00227-7, https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.010

2.專利：一種高通量快速磁珠法提取植物基因組DNA的試劑盒及提取方法，202010940039.7

3.專利：一種底部側(cè)吸式磁力架，ZL202021917582.7

4.專利：一種基于NGS測(cè)序的AcDs全基因組位點(diǎn)高效檢測(cè)引物和方法，202011139059.0

5.專利：一種便攜式96孔超順納米磁珠操作儀，ZL202021400342.X

6.專利：一種基于磁珠法的高通量便攜式核酸提取儀， 202010684707.4

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總結(jié)

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